More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0070 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  100 
 
 		 1951 aa  3939    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  46.5 
 
 		 2528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  42.71 
 
 		 777 aa  259  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  50.38 
 
 		 2042 aa  233  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  49.81 
 
 		 1804 aa  230  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  39.52 
 
 		 549 aa  225  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  45.42 
 
 		 916 aa  225  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  35.07 
 
 		 2117 aa  209  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1657 aa  208  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  39.14 
 
 		 899 aa  205  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  23.9 
 
 		 5743 aa  204  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  35.7 
 
 		 1902 aa  196  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  37.71 
 
 		 898 aa  194  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  30.8 
 
 		 913 aa  182  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.39 
 
 		 3586 aa  173  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  40.67 
 
 		 2192 aa  170  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  39.23 
 
 		 937 aa  161  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.15 
 
 		 888 aa  158  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1585 aa  148  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1588 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  35.11 
 
 		 906 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  25.41 
 
 		 3925 aa  138  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.92 
 
 		 1919 aa  115  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  46.72 
 
 		 793 aa  102  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 6109 aa  95.5  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  30 
 
 		 692 aa  95.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  26.91 
 
 		 2704 aa  93.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  37.71 
 
 		 1222 aa  91.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  25.71 
 
 		 3736 aa  91.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.13 
 
 		 3562 aa  89.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.76 
 
 		 1332 aa  88.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1825 aa  88.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  25.99 
 
 		 4689 aa  86.7  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  25.83 
 
 		 3734 aa  85.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  42.75 
 
 		 373 aa  84.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  27.82 
 
 		 1461 aa  84.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  25.11 
 
 		 3325 aa  82  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1608 aa  81.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  25.07 
 
 		 3824 aa  80.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  51.04 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.15 
 
 		 2350 aa  79.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  25.42 
 
 		 3824 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2625 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  35.71 
 
 		 1040 aa  76.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.61 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  35.71 
 
 		 1042 aa  76.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  25.03 
 
 		 3824 aa  74.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  30.85 
 
 		 1014 aa  75.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.95 
 
 		 430 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.29 
 
 		 1096 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  25.03 
 
 		 3721 aa  73.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.93 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  24.61 
 
 		 1219 aa  72.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1042 aa  72.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  39.44 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1201 aa  72.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  24.52 
 
 		 3739 aa  72.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  43.9 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 		 3552 aa  71.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.47 
 
 		 590 aa  70.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  30.31 
 
 		 913 aa  70.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.41 
 
 		 1570 aa  69.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.2 
 
 		 2456 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.32 
 
 		 717 aa  69.7  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  40.96 
 
 		 604 aa  68.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.12 
 
 		 443 aa  68.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  31.28 
 
 		 975 aa  68.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  22.79 
 
 		 2552 aa  67.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  24.45 
 
 		 4874 aa  67.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.69 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  32.14 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  28.84 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 		 1726 aa  64.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.69 
 
 		 427 aa  64.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  36.14 
 
 		 759 aa  64.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  24.41 
 
 		 1570 aa  64.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.19 
 
 		 1059 aa  64.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  25.8 
 
 		 432 aa  63.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 642 aa  63.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.77 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.26 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  30.12 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  24.79 
 
 		 4106 aa  62.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  28.09 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.35 
 
 		 432 aa  61.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 442 aa  62  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  33.62 
 
 		 1005 aa  62  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.1 
 
 		 432 aa  62  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.13 
 
 		 3314 aa  62  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  31.01 
 
 		 1031 aa  61.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.9 
 
 		 3227 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.07 
 
 		 415 aa  60.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.91 
 
 		 5561 aa  61.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  25.19 
 
 		 398 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.47 
 
 		 5561 aa  61.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.82 
 
 		 940 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.33 
 
 		 639 aa  60.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 430 aa  60.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  27.78 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.65 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>