283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0535 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 672 aa  1375    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  36.22 
 
 		 686 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  36.6 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  34.57 
 
 		 694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  31.78 
 
 		 702 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  32.32 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 666 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.7 
 
 		 440 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.82 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.57 
 
 		 438 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  26.13 
 
 		 496 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  22.73 
 
 		 478 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25 
 
 		 1014 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  22.65 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  23.88 
 
 		 484 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25.58 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  23.73 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  24.94 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.41 
 
 		 1060 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  23.06 
 
 		 490 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  22.48 
 
 		 455 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  23.22 
 
 		 1062 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  22.84 
 
 		 1062 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  22.84 
 
 		 1062 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  22.62 
 
 		 1062 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  22.12 
 
 		 1081 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  22.62 
 
 		 1062 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  22.17 
 
 		 1069 aa  91.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.21 
 
 		 1005 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  22.62 
 
 		 598 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.44 
 
 		 819 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.36 
 
 		 585 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  23.64 
 
 		 1010 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  24.09 
 
 		 568 aa  88.6  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  22.81 
 
 		 540 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  22.68 
 
 		 1062 aa  87.4  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  22.25 
 
 		 543 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.05 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.89 
 
 		 1111 aa  84  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  23.04 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  22.15 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  23.89 
 
 		 1052 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  25.66 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  22.2 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  20.89 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  22.87 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  21.35 
 
 		 1084 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.96 
 
 		 1113 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  22.53 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.78 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.77 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.3 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  23.32 
 
 		 440 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  22.22 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  21.38 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  22.03 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.71 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  23.57 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.76 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  20.44 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  22.39 
 
 		 440 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  21.4 
 
 		 1071 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  23.01 
 
 		 435 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  33.9 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  23.11 
 
 		 414 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  21.69 
 
 		 1078 aa  70.1  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  38.95 
 
 		 1062 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  21.03 
 
 		 1062 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  37.89 
 
 		 1049 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  22.62 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  37.89 
 
 		 1062 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.72 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  22.01 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  22.44 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  24.37 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  22.32 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  22.05 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  22.82 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  22.39 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  20.39 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.7 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  21.97 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  22.98 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  22 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  36.84 
 
 		 1067 aa  65.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  21.67 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  25.6 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  25.6 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  25.6 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  22.8 
 
 		 1031 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  22.88 
 
 		 456 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  21.57 
 
 		 426 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  22.9 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  21.97 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1066 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  22.96 
 
 		 1059 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  37.08 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  22.29 
 
 		 416 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  22.05 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>