290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2093 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  77.48 
 
 		 405 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  79.67 
 
 		 441 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  100 
 
 		 431 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  75.38 
 
 		 430 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  54.41 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  47.56 
 
 		 445 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  47.7 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  42.37 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  39.58 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  38.77 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  39.95 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  41.18 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  40.54 
 
 		 412 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  38.14 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  38.14 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  39.47 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  39.67 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  40.87 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  40.87 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  40.87 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  39.66 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  39.66 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  39.66 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  40.29 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  39.56 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  37.59 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  39.25 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  38.89 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.38 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  37.41 
 
 		 437 aa  256  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  39.17 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  39.36 
 
 		 402 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  40 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  37.31 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  37.32 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  36.17 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.68 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  35.68 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  36.62 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.35 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  36.02 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.48 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  40.11 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  37.1 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  35.96 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  36.3 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  38.14 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  36.79 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  34.03 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  33.51 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  35.24 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  37.53 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  33.61 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.18 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.23 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  34.57 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.16 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.33 
 
 		 421 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  33.25 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  33.71 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  33.65 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  30.29 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  29.83 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.93 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  31.68 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  31.48 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  30.1 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  33.33 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  32.49 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  29.81 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.64 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 		 445 aa  176  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29.88 
 
 		 413 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  29.51 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.06 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  31.76 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.97 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  31.35 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.88 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.09 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.97 
 
 		 419 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.19 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  31.03 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.08 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.36 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  27.47 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.61 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.22 
 
 		 461 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  32.54 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  29.93 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  27.16 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  29.19 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  32.44 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  30.5 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  30.5 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  31.76 
 
 		 431 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  31.9 
 
 		 396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.02 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  32.78 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>