249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2416 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  100 
 
 		 702 aa  1415    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  41.64 
 
 		 694 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  41.52 
 
 		 692 aa  482  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  34.26 
 
 		 686 aa  346  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  31.78 
 
 		 672 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  33.6 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 666 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  28.42 
 
 		 483 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  30.56 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  29.58 
 
 		 478 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  31.6 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  30.73 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  30.7 
 
 		 496 aa  117  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  27.29 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  28.12 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.59 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25.85 
 
 		 455 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.46 
 
 		 1010 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  28.5 
 
 		 511 aa  94.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  29.04 
 
 		 819 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.07 
 
 		 402 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.94 
 
 		 421 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  27.17 
 
 		 1031 aa  91.3  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  23.15 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  26.65 
 
 		 484 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  24.39 
 
 		 451 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.44 
 
 		 1005 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  25.94 
 
 		 429 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.67 
 
 		 435 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  26.88 
 
 		 1138 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  24.62 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  25.38 
 
 		 1084 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  24.82 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  25.79 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.42 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.86 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  27.06 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  22.93 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  27.01 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  44.55 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  27.01 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  27.01 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  26.62 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  24.23 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  26.98 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.79 
 
 		 1069 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  22.83 
 
 		 1062 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.07 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  24.1 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  24.1 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  24.1 
 
 		 598 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.89 
 
 		 1059 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  45.19 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.14 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.33 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  23.86 
 
 		 1062 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.34 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  26.93 
 
 		 1113 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  29.13 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  26.63 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  27.19 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  25.52 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.44 
 
 		 1014 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  22.42 
 
 		 1049 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  24.28 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  22.82 
 
 		 1081 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.06 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  39.81 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.95 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.12 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.4 
 
 		 407 aa  73.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  22.71 
 
 		 1062 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.34 
 
 		 1062 aa  73.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  40.8 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  25.1 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.13 
 
 		 1065 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  22.17 
 
 		 1062 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  22.41 
 
 		 1062 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  26.07 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  27.61 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  39.31 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  36.36 
 
 		 433 aa  72  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  25 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.56 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  27.31 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1042 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  24.2 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  22.33 
 
 		 1067 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.55 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  25.86 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.71 
 
 		 1078 aa  70.5  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.54 
 
 		 426 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  23.16 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  24.65 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  38.46 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  22.68 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.15 
 
 		 1040 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  26.88 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>