253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4683 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  65.04 
 
 		 529 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  100 
 
 		 540 aa  1116    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  54.27 
 
 		 543 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  27.29 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  24.15 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  27.31 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.24 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.88 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  23.77 
 
 		 686 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  24.63 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  24.63 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  24.84 
 
 		 409 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.81 
 
 		 672 aa  87.8  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.06 
 
 		 478 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.18 
 
 		 680 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  26.12 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  25.21 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.27 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  23.95 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.39 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  23.83 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  24.95 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.3 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  25.2 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  23.74 
 
 		 1014 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.29 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  22 
 
 		 1005 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.5 
 
 		 1111 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  23.26 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.39 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.47 
 
 		 1138 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.93 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 666 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  20.67 
 
 		 1113 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.77 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  26.82 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  24.41 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  22.81 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  23.58 
 
 		 415 aa  67  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  50.77 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  21.84 
 
 		 401 aa  67  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.73 
 
 		 1062 aa  67  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  25.59 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  21.83 
 
 		 1060 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.9 
 
 		 819 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  23.52 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  41.35 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  22.86 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  42.86 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  22.6 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  22.8 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  43.9 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  24.06 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.05 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  23.44 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  36.7 
 
 		 435 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  43 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  39.39 
 
 		 583 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  22.65 
 
 		 1010 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  25.29 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  27.8 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  36.19 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  38 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  20.5 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  40 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  21.72 
 
 		 407 aa  57  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  37.04 
 
 		 444 aa  57  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  39 
 
 		 578 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  20 
 
 		 694 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 582 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  22.98 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  21 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  29.24 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.63 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.46 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  29.71 
 
 		 411 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  36.17 
 
 		 433 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  42.86 
 
 		 572 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.81 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  39 
 
 		 566 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  39.56 
 
 		 431 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  40.96 
 
 		 391 aa  53.9  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  29.66 
 
 		 438 aa  53.5  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.21 
 
 		 419 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  34.48 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  34.75 
 
 		 1059 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  30 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  29.82 
 
 		 576 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  37.18 
 
 		 424 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  28.99 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  34.23 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  33.33 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  45 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  34.53 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  22.17 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.01 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  44.07 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  38.83 
 
 		 587 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>