More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0356 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  100 
 
 		 577 aa  1169    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  62.56 
 
 		 578 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  53.15 
 
 		 581 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  50.95 
 
 		 578 aa  594  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  50.61 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  52.7 
 
 		 589 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  52.6 
 
 		 574 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  51.64 
 
 		 575 aa  571  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  52.26 
 
 		 579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  48.7 
 
 		 583 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  51.85 
 
 		 580 aa  555  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  47.03 
 
 		 590 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  48 
 
 		 574 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  50.17 
 
 		 573 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  50 
 
 		 573 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  50.17 
 
 		 573 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  45.77 
 
 		 579 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  48.6 
 
 		 570 aa  538  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  46.94 
 
 		 581 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  50.09 
 
 		 566 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  45.34 
 
 		 569 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  46.6 
 
 		 586 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  45.08 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  43.93 
 
 		 601 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  42.81 
 
 		 582 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  44.05 
 
 		 586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  44.05 
 
 		 586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  44.05 
 
 		 586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  41.57 
 
 		 578 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  42.43 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  42.68 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  38.53 
 
 		 567 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  35.73 
 
 		 560 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  33.11 
 
 		 560 aa  279  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.68 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  31.77 
 
 		 588 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  31.42 
 
 		 577 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  28.64 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.43 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.76 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.55 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  29.57 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.57 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.57 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.86 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.99 
 
 		 565 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.03 
 
 		 493 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.03 
 
 		 493 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.03 
 
 		 493 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.23 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.52 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.52 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.99 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  28.7 
 
 		 493 aa  153  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.21 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.03 
 
 		 534 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.06 
 
 		 475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.06 
 
 		 475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.06 
 
 		 475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.06 
 
 		 475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.5 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  29.86 
 
 		 558 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.96 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.71 
 
 		 493 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.05 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.74 
 
 		 545 aa  144  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.82 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.79 
 
 		 528 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  25.65 
 
 		 530 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.41 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.66 
 
 		 534 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  25.61 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  25 
 
 		 485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  27.23 
 
 		 611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  26.22 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  24.58 
 
 		 1076 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.17 
 
 		 533 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.87 
 
 		 491 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.31 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.22 
 
 		 507 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 		 499 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  32.12 
 
 		 629 aa  124  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  23.65 
 
 		 487 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.82 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.45 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  36.73 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.91 
 
 		 487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.32 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.71 
 
 		 525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  27.2 
 
 		 587 aa  120  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.21 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  37.5 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.5 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.71 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.63 
 
 		 511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  34.76 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.71 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.22 
 
 		 529 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>