283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6853 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  100 
 
 
567 aa  1129    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  42.61 
 
 
579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  41.99 
 
 
581 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  44.27 
 
 
587 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  42.43 
 
 
579 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  42.44 
 
 
586 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  42.05 
 
 
587 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  40.56 
 
 
583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  41.51 
 
 
572 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
586 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
586 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
586 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  39.13 
 
 
569 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  41.46 
 
 
570 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  40.35 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  42.86 
 
 
580 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  40.18 
 
 
574 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  40.94 
 
 
579 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  38.05 
 
 
590 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  38.53 
 
 
577 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  38.02 
 
 
582 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  38.95 
 
 
601 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  40.28 
 
 
574 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  37.37 
 
 
578 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  39.93 
 
 
575 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  40.55 
 
 
589 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  41.54 
 
 
566 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  37.87 
 
 
578 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  40.56 
 
 
573 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  40.56 
 
 
573 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  40.56 
 
 
573 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  36.47 
 
 
581 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  38.42 
 
 
560 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  35.54 
 
 
588 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.91 
 
 
556 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  31.89 
 
 
560 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  30.77 
 
 
577 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  30.3 
 
 
582 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  29.43 
 
 
580 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.9 
 
 
565 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.34 
 
 
528 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.02 
 
 
532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  25.25 
 
 
589 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  27.88 
 
 
611 aa  145  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.87 
 
 
499 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.33 
 
 
534 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  28.33 
 
 
530 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.6 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.85 
 
 
529 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  25.86 
 
 
530 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  28.89 
 
 
587 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.35 
 
 
534 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.92 
 
 
477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  29 
 
 
598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  27.37 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  28.67 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  28.67 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.55 
 
 
534 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.32 
 
 
545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.79 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.66 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  39.18 
 
 
486 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  27.1 
 
 
533 aa  124  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.74 
 
 
487 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.82 
 
 
532 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.21 
 
 
507 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  28.37 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.93 
 
 
1076 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.57 
 
 
480 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.59 
 
 
494 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.1 
 
 
651 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  28.25 
 
 
620 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  25.51 
 
 
579 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  38.46 
 
 
493 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  39.53 
 
 
490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  36.36 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.85 
 
 
491 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.94 
 
 
487 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.86 
 
 
493 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  32.92 
 
 
629 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.66 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.85 
 
 
493 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.35 
 
 
493 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  35.86 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.65 
 
 
490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.86 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.86 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.18 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.07 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.17 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.35 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  33 
 
 
504 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.35 
 
 
493 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.35 
 
 
493 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.32 
 
 
499 aa  110  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  26.45 
 
 
557 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.85 
 
 
493 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.85 
 
 
493 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  32.67 
 
 
485 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>