186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1221 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.17 
 
 		 499 aa  684    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  66.74 
 
 		 493 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 490 aa  993    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  91.51 
 
 		 493 aa  910    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.48 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  50.1 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.1 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.1 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.55 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.28 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.73 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.65 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  49.67 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.65 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.24 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.76 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.83 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.96 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.41 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.41 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.41 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.96 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.96 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.96 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.83 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.31 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.7 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  47.42 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  49.9 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  45.96 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  46.47 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.27 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.69 
 
 		 487 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.12 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.6 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.12 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.12 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  45.73 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.54 
 
 		 477 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.95 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.38 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.8 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  45.92 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.2 
 
 		 478 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  44.35 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.8 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  38.55 
 
 		 533 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  34.9 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.95 
 
 		 534 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.4 
 
 		 533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.24 
 
 		 532 aa  267  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 		 528 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.5 
 
 		 530 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.69 
 
 		 516 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 		 525 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.18 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.08 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.11 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.06 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.71 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.99 
 
 		 487 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.57 
 
 		 1076 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.17 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.68 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.21 
 
 		 565 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.64 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.05 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.67 
 
 		 848 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.42 
 
 		 651 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  32.71 
 
 		 533 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.96 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.31 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.74 
 
 		 557 aa  193  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.39 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  32.08 
 
 		 539 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.45 
 
 		 527 aa  180  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.6 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.72 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  29.2 
 
 		 456 aa  173  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.81 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30 
 
 		 531 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  36.39 
 
 		 558 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  26.73 
 
 		 556 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  28.95 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.9 
 
 		 548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  33.33 
 
 		 620 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  35.89 
 
 		 523 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  34.5 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  26.11 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  37.68 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  34.65 
 
 		 567 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  37.13 
 
 		 588 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  26.93 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  35.5 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  33.2 
 
 		 580 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 579 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  25 
 
 		 579 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  29.29 
 
 		 581 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>