More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0622 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  99.83 
 
 		 573 aa  1150    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  100 
 
 		 573 aa  1151    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  78.15 
 
 		 574 aa  910    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  100 
 
 		 573 aa  1151    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  79.23 
 
 		 575 aa  925    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  55.54 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  53.77 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  52.96 
 
 		 580 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  51.41 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  50.78 
 
 		 578 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  50.17 
 
 		 577 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  50.27 
 
 		 572 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  49.13 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  48.42 
 
 		 581 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  49.39 
 
 		 566 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  46.58 
 
 		 579 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  46.71 
 
 		 574 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  46.34 
 
 		 590 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  46.93 
 
 		 601 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  45.98 
 
 		 581 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  45.52 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  43.88 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  42.74 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  44.46 
 
 		 586 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  42.33 
 
 		 582 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  43.34 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  42.61 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  41.1 
 
 		 586 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  41.17 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  41.1 
 
 		 586 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  41.1 
 
 		 586 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  40.56 
 
 		 567 aa  363  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.09 
 
 		 560 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  34.79 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  33.74 
 
 		 560 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  31.48 
 
 		 577 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  30.74 
 
 		 588 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 582 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.01 
 
 		 547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.66 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.83 
 
 		 545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.48 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  28.03 
 
 		 598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.52 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 533 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  28.03 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  28.03 
 
 		 598 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.11 
 
 		 565 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.34 
 
 		 488 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  27.45 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.11 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  26.52 
 
 		 604 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 530 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.06 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.85 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  27.09 
 
 		 611 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  29.97 
 
 		 629 aa  123  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  25.09 
 
 		 589 aa  122  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.42 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.76 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  27.53 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.98 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.96 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.09 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.39 
 
 		 494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.47 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  36 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.27 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.68 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.18 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.64 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  24.65 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.13 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  27.1 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  24.11 
 
 		 1076 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  33.5 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  24.62 
 
 		 530 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  35.9 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  32.99 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.05 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  34.17 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.98 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  31.98 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.54 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.48 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  34.17 
 
 		 490 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.98 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.14 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.54 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  30.77 
 
 		 579 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.48 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.48 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  34 
 
 		 588 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  34 
 
 		 584 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  34 
 
 		 588 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  34 
 
 		 700 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  34 
 
 		 584 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  34 
 
 		 699 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  34 
 
 		 418 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>