More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0027 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  831    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  829    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  830    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  100 
 
 
700 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  96.08 
 
 
584 aa  769    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  100 
 
 
418 aa  848    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  830    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  59.8 
 
 
611 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  59.17 
 
 
604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  56.72 
 
 
587 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  57.64 
 
 
598 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  57.88 
 
 
598 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  57.88 
 
 
598 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  49.88 
 
 
579 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  33.5 
 
 
629 aa  216  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  59.09 
 
 
339 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  32.07 
 
 
588 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.95 
 
 
532 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  33.89 
 
 
579 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  33.66 
 
 
583 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  31.43 
 
 
570 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  29.85 
 
 
556 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  32.54 
 
 
577 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  30.86 
 
 
580 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  31.45 
 
 
582 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  32.39 
 
 
560 aa  104  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  32.26 
 
 
574 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  34.5 
 
 
590 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.38 
 
 
560 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  32.41 
 
 
578 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  32.17 
 
 
569 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.15 
 
 
494 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.31 
 
 
486 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  36.2 
 
 
589 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  32 
 
 
567 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  38.31 
 
 
493 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
581 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  39.02 
 
 
490 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  32.91 
 
 
582 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  32.66 
 
 
575 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  34 
 
 
573 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  34 
 
 
573 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  32.62 
 
 
566 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  34 
 
 
573 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  31.84 
 
 
578 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  32.08 
 
 
580 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.83 
 
 
477 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  30.81 
 
 
581 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.5 
 
 
491 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
586 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  30.81 
 
 
534 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  37.95 
 
 
577 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  34.47 
 
 
487 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  34.48 
 
 
486 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  30 
 
 
579 aa  93.2  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
493 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  28.24 
 
 
587 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  28.8 
 
 
574 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.83 
 
 
533 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  28.29 
 
 
587 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33 
 
 
493 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33 
 
 
493 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.01 
 
 
494 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  34.13 
 
 
601 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
493 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.71 
 
 
534 aa  89.7  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  29.7 
 
 
586 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.01 
 
 
494 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
493 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.01 
 
 
494 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
493 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.48 
 
 
495 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  31.53 
 
 
481 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  30.24 
 
 
572 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  30.58 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.39 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.84 
 
 
488 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  30.29 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  28.22 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  30.16 
 
 
493 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  31.68 
 
 
493 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.39 
 
 
491 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.34 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  32.16 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.53 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.16 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.16 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.36 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  31.19 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.36 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.5 
 
 
522 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  32.51 
 
 
558 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.69 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  26.69 
 
 
579 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.36 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>