178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2752 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  57.51 
 
 
588 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  57.58 
 
 
700 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  57.9 
 
 
584 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1222    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1222    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  80.44 
 
 
604 aa  979    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  57.19 
 
 
699 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  57.9 
 
 
584 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  98.83 
 
 
598 aa  1205    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  57.9 
 
 
584 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  57.51 
 
 
588 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  56.52 
 
 
611 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  53.94 
 
 
587 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  48.44 
 
 
579 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  80.24 
 
 
339 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  57.88 
 
 
418 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  33.54 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  48.78 
 
 
207 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  31.35 
 
 
588 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  56.97 
 
 
166 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
556 aa  167  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  30.37 
 
 
560 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  29.34 
 
 
575 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  27.5 
 
 
560 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.45 
 
 
582 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  30.88 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  27.93 
 
 
570 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  27.97 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  28.26 
 
 
581 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  28.36 
 
 
569 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  28.31 
 
 
577 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  27.8 
 
 
583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  29.08 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  25.8 
 
 
580 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  27.63 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  28.36 
 
 
574 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  28.03 
 
 
573 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  28.03 
 
 
573 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  28.03 
 
 
573 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  27.36 
 
 
580 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  26.61 
 
 
579 aa  123  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  26.27 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  25.93 
 
 
587 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  27.51 
 
 
577 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  26.18 
 
 
578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  27.65 
 
 
601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.89 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  24.29 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  26.4 
 
 
582 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  26 
 
 
586 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  26 
 
 
586 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  26 
 
 
586 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  24.48 
 
 
530 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  25.6 
 
 
533 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.16 
 
 
493 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.16 
 
 
493 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  33.2 
 
 
578 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  27.2 
 
 
589 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  33.66 
 
 
493 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.66 
 
 
493 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.66 
 
 
493 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.17 
 
 
493 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  34.16 
 
 
493 aa  100  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  24.92 
 
 
581 aa  100  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.66 
 
 
493 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.66 
 
 
493 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.99 
 
 
493 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.67 
 
 
493 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.67 
 
 
493 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  32.94 
 
 
587 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  25.21 
 
 
530 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  22.86 
 
 
546 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.43 
 
 
532 aa  95.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.84 
 
 
493 aa  94.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  25.34 
 
 
566 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32 
 
 
494 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  31.86 
 
 
487 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.17 
 
 
495 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  32.94 
 
 
586 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  26.12 
 
 
572 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  31.54 
 
 
579 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.54 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.9 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  31.84 
 
 
486 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  31.19 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  31.19 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  31.19 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  31.19 
 
 
475 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.17 
 
 
486 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  31.16 
 
 
493 aa  89  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  30.69 
 
 
481 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  31.68 
 
 
485 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.03 
 
 
565 aa  87.8  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  21.35 
 
 
528 aa  87.4  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.36 
 
 
491 aa  87  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  28.43 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  30.88 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.51 
 
 
499 aa  84  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.93 
 
 
477 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.22 
 
 
547 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>