256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0366 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  80.82 
 
 
475 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  67.36 
 
 
494 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  80.82 
 
 
475 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.9 
 
 
487 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  83.3 
 
 
493 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
495 aa  1013    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  67.23 
 
 
485 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  69.06 
 
 
494 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.54 
 
 
493 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  84.05 
 
 
493 aa  853    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  89.37 
 
 
493 aa  881    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  68.19 
 
 
487 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.74 
 
 
493 aa  857    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.94 
 
 
493 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.96 
 
 
493 aa  866    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  88.34 
 
 
493 aa  898    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.94 
 
 
493 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.74 
 
 
493 aa  857    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.54 
 
 
493 aa  857    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  69.06 
 
 
494 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  80.82 
 
 
475 aa  809    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  80.82 
 
 
475 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  83.3 
 
 
493 aa  844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  83.3 
 
 
493 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  65.13 
 
 
504 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.5 
 
 
491 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.85 
 
 
479 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  61.52 
 
 
480 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  60.08 
 
 
481 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  59.58 
 
 
499 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  51.65 
 
 
499 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  50.92 
 
 
493 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  49.47 
 
 
493 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.63 
 
 
486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.84 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  48.23 
 
 
486 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.57 
 
 
494 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  48.43 
 
 
490 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.79 
 
 
493 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.02 
 
 
488 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.58 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.41 
 
 
478 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.81 
 
 
484 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.2 
 
 
478 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.2 
 
 
478 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.95 
 
 
478 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.31 
 
 
490 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.16 
 
 
478 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.02 
 
 
532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  38.2 
 
 
533 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.37 
 
 
525 aa  277  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
530 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.59 
 
 
530 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.57 
 
 
534 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  36.54 
 
 
848 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.44 
 
 
499 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.81 
 
 
516 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31 
 
 
533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.02 
 
 
528 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  34.21 
 
 
522 aa  253  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.4 
 
 
547 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.52 
 
 
534 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 
651 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.76 
 
 
565 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.5 
 
 
545 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  31.57 
 
 
1076 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.68 
 
 
534 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.27 
 
 
529 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.03 
 
 
532 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.78 
 
 
533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.77 
 
 
487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.33 
 
 
529 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.26 
 
 
557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.11 
 
 
531 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.78 
 
 
511 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.42 
 
 
507 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  32.14 
 
 
539 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.52 
 
 
546 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  29.57 
 
 
534 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.31 
 
 
527 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.58 
 
 
620 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  27.5 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  36.86 
 
 
558 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.37 
 
 
528 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  28.57 
 
 
456 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  27.96 
 
 
577 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  28.86 
 
 
481 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.48 
 
 
558 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.29 
 
 
548 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  32.81 
 
 
589 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  25.3 
 
 
569 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  26.33 
 
 
579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  26.84 
 
 
581 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  39.69 
 
 
583 aa  116  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  36.08 
 
 
556 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  25.36 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  36.22 
 
 
582 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  37.56 
 
 
588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  35.32 
 
 
567 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  32.14 
 
 
580 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>