More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2091 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  100 
 
 		 560 aa  1118    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  41.42 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  37.94 
 
 		 560 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  37.29 
 
 		 569 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  37.93 
 
 		 587 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  35.02 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  35.17 
 
 		 578 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  36.15 
 
 		 582 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  38.91 
 
 		 588 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  38.42 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  35.51 
 
 		 583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  36.82 
 
 		 581 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 586 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 586 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 586 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  35.62 
 
 		 577 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  34.85 
 
 		 590 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  36.36 
 
 		 580 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  38.13 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  36.2 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  34.69 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  35.11 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  38.68 
 
 		 589 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  35.54 
 
 		 578 aa  293  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  37.09 
 
 		 573 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  37.09 
 
 		 573 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  37.09 
 
 		 573 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  34.02 
 
 		 581 aa  292  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  36.18 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  36.14 
 
 		 575 aa  289  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  35.75 
 
 		 586 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  33.56 
 
 		 579 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  37.39 
 
 		 566 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  33.68 
 
 		 572 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  35.7 
 
 		 570 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  35.37 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  33.05 
 
 		 601 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  32.11 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.18 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 582 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.89 
 
 		 532 aa  187  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.2 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.26 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.45 
 
 		 528 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.11 
 
 		 478 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.68 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.21 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.27 
 
 		 534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.77 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.27 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.43 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.46 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  28.48 
 
 		 589 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.67 
 
 		 529 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  28.91 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  28.79 
 
 		 1076 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  27.95 
 
 		 557 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.26 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  28.73 
 
 		 611 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  29.51 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  43.3 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.56 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.95 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  43.52 
 
 		 494 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  42.27 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  23.7 
 
 		 579 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  28.64 
 
 		 587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  38.14 
 
 		 530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.37 
 
 		 493 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.62 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.09 
 
 		 484 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  42.56 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.26 
 
 		 478 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  28.1 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  28.1 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  28.1 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.03 
 
 		 488 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  36.36 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.78 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.06 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.96 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  40.91 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.92 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.92 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.92 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  27.92 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.24 
 
 		 499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.95 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.08 
 
 		 481 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  39.39 
 
 		 558 aa  113  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  37.11 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  33.08 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.76 
 
 		 499 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  36.23 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.92 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  32.06 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.5 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.79 
 
 		 493 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  36.23 
 
 		 598 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>