254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5252 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1162    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  55.56 
 
 		 579 aa  675    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  55.11 
 
 		 581 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  51.79 
 
 		 586 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  49.83 
 
 		 587 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  48.77 
 
 		 583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  49.91 
 
 		 587 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  47.8 
 
 		 578 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  47.01 
 
 		 582 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  49.23 
 
 		 586 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  49.23 
 
 		 586 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  49.23 
 
 		 586 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  48.31 
 
 		 572 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  48.95 
 
 		 579 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  44.7 
 
 		 579 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  45.55 
 
 		 601 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  45.53 
 
 		 574 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  45.34 
 
 		 577 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  43.2 
 
 		 590 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  45.77 
 
 		 580 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  43.77 
 
 		 578 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  47.17 
 
 		 581 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  46.23 
 
 		 575 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  47.01 
 
 		 566 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  44.39 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  45.01 
 
 		 574 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  43.74 
 
 		 578 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  45.52 
 
 		 573 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  45.52 
 
 		 573 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  44.52 
 
 		 589 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  45.34 
 
 		 573 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  39.13 
 
 		 567 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.29 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  33.79 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.72 
 
 		 556 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 588 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  29.59 
 
 		 580 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 577 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 582 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.55 
 
 		 530 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.4 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.01 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.81 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.76 
 
 		 547 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  26.37 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.87 
 
 		 565 aa  137  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.87 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.62 
 
 		 533 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.87 
 
 		 478 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  28.55 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.89 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.77 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.67 
 
 		 1076 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  27.84 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  24.83 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  27.84 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  27.84 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.39 
 
 		 528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.07 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  25.35 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  35.4 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.78 
 
 		 487 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  27.36 
 
 		 604 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  26.59 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.34 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.44 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  37.31 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.78 
 
 		 493 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.78 
 
 		 493 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.26 
 
 		 493 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.26 
 
 		 493 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.52 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.39 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.69 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.46 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.91 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.44 
 
 		 478 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  26.32 
 
 		 557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.82 
 
 		 491 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  33.91 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.44 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.44 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.3 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.44 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  33.74 
 
 		 629 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  31.39 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.32 
 
 		 491 aa  114  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  24.26 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  28.96 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  36.6 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  27.74 
 
 		 584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  29.07 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.71 
 
 		 488 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.07 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.07 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.37 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  26.85 
 
 		 587 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  28.31 
 
 		 584 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  28.31 
 
 		 584 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  23.99 
 
 		 589 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>