290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5030 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  94.75 
 
 
478 aa  884    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  99.79 
 
 
478 aa  951    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  87.18 
 
 
491 aa  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  94.33 
 
 
478 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
478 aa  952    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  99.37 
 
 
478 aa  946    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.69 
 
 
488 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.66 
 
 
484 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  57.65 
 
 
486 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  56.12 
 
 
493 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.16 
 
 
494 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  55.56 
 
 
490 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  53.67 
 
 
486 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  50.11 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.93 
 
 
493 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.15 
 
 
493 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.11 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.93 
 
 
493 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.11 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  47.69 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.15 
 
 
493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.06 
 
 
487 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.68 
 
 
493 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.5 
 
 
493 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.5 
 
 
493 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.41 
 
 
495 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.57 
 
 
493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.65 
 
 
493 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.75 
 
 
491 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  47.06 
 
 
504 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  46.44 
 
 
480 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  44.81 
 
 
481 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.78 
 
 
493 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  47.17 
 
 
487 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.91 
 
 
479 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  47.54 
 
 
493 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.2 
 
 
477 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.2 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.76 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.58 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.03 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.76 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.2 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.2 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.2 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  46.46 
 
 
494 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.93 
 
 
493 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.2 
 
 
490 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.47 
 
 
533 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.47 
 
 
528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.76 
 
 
532 aa  302  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  37.95 
 
 
533 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  35.23 
 
 
530 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  36.13 
 
 
534 aa  282  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  37.31 
 
 
522 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.98 
 
 
534 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.29 
 
 
530 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.13 
 
 
487 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.62 
 
 
534 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.58 
 
 
529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.2 
 
 
511 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.77 
 
 
516 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  34.21 
 
 
558 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.64 
 
 
547 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.93 
 
 
545 aa  243  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.09 
 
 
565 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  31.65 
 
 
1076 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.5 
 
 
525 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.08 
 
 
532 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.66 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33 
 
 
848 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.68 
 
 
557 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.8 
 
 
499 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.89 
 
 
651 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.14 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  30.89 
 
 
534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 
533 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.64 
 
 
531 aa  193  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  31.87 
 
 
560 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  28.28 
 
 
456 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  27.72 
 
 
523 aa  180  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.35 
 
 
527 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  32.33 
 
 
620 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  37.25 
 
 
589 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.45 
 
 
546 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.58 
 
 
558 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  30.3 
 
 
481 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
581 aa  146  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  28.9 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  32.22 
 
 
539 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  27.59 
 
 
560 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  39.1 
 
 
588 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  29.46 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.9 
 
 
548 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  39.57 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  41.12 
 
 
587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  35.9 
 
 
581 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  37.36 
 
 
579 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  34.82 
 
 
582 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  37.39 
 
 
569 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>