More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3714 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  66.04 
 
 		 486 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.71 
 
 		 494 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  100 
 
 		 486 aa  999    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  66.88 
 
 		 490 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  64.58 
 
 		 493 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.47 
 
 		 488 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.18 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.67 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.88 
 
 		 478 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.3 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.46 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.67 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.46 
 
 		 478 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.06 
 
 		 493 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  48.85 
 
 		 485 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.55 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  49.06 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  49.06 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.13 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  49.06 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.34 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.34 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.23 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.76 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.68 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.72 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.72 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.72 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.81 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.67 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.81 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.81 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.81 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  46.64 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.04 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  46.46 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.29 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  47.5 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  45.3 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  46.33 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.71 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.68 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  45.06 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.03 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.03 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.7 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.92 
 
 		 490 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 530 aa  316  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.95 
 
 		 532 aa  309  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  37.43 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  35.58 
 
 		 530 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.26 
 
 		 528 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.7 
 
 		 533 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.69 
 
 		 522 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.52 
 
 		 534 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.08 
 
 		 534 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  33.14 
 
 		 1076 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.47 
 
 		 547 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.48 
 
 		 534 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.26 
 
 		 516 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.54 
 
 		 525 aa  246  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.02 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.74 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.9 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.99 
 
 		 557 aa  238  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.97 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.6 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  32.35 
 
 		 848 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.72 
 
 		 545 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  32.09 
 
 		 558 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.77 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.73 
 
 		 507 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.93 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.87 
 
 		 511 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.66 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  30.39 
 
 		 539 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.22 
 
 		 651 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.84 
 
 		 531 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.15 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.37 
 
 		 620 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  28.79 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  29.85 
 
 		 456 aa  173  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.19 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.41 
 
 		 528 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  29.52 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.91 
 
 		 558 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.33 
 
 		 548 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  37.4 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  43.15 
 
 		 560 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  31.62 
 
 		 589 aa  136  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  43.01 
 
 		 588 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  35.63 
 
 		 582 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  37.19 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  40.1 
 
 		 578 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  40.1 
 
 		 583 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  35.17 
 
 		 569 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  38.38 
 
 		 567 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  36.5 
 
 		 577 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  35.29 
 
 		 581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>