207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2657 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  67.56 
 
 
494 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.95 
 
 
475 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.19 
 
 
487 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  84.58 
 
 
493 aa  856    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
493 aa  1001    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  96.96 
 
 
493 aa  974    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  86 
 
 
493 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  85.4 
 
 
493 aa  853    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  69.15 
 
 
487 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  96.35 
 
 
493 aa  971    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.35 
 
 
494 aa  656    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  83.94 
 
 
495 aa  840    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
493 aa  1001    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  96.35 
 
 
493 aa  971    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  97.16 
 
 
493 aa  978    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.95 
 
 
475 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.95 
 
 
475 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  84.58 
 
 
493 aa  856    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.35 
 
 
494 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  84.58 
 
 
493 aa  856    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.38 
 
 
493 aa  864    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.95 
 
 
475 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  95.94 
 
 
493 aa  968    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  64.27 
 
 
485 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.63 
 
 
479 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  63 
 
 
504 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  61.1 
 
 
481 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  61.01 
 
 
499 aa  588  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  60.47 
 
 
480 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  49.89 
 
 
493 aa  458  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.32 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.77 
 
 
499 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 
488 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  49.79 
 
 
493 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.84 
 
 
486 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.41 
 
 
494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.27 
 
 
484 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.04 
 
 
493 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  48.34 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.07 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.08 
 
 
478 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.5 
 
 
478 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.29 
 
 
478 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.5 
 
 
478 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  48.33 
 
 
490 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.65 
 
 
490 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.44 
 
 
478 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.45 
 
 
532 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  33.65 
 
 
530 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  35.19 
 
 
530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  36.15 
 
 
848 aa  262  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.5 
 
 
525 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.97 
 
 
499 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.27 
 
 
534 aa  259  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.26 
 
 
516 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.2 
 
 
1076 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.93 
 
 
533 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.64 
 
 
534 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.64 
 
 
528 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.7 
 
 
547 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.52 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.64 
 
 
529 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.97 
 
 
533 aa  236  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.99 
 
 
565 aa  234  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.26 
 
 
545 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 
651 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.83 
 
 
534 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.18 
 
 
507 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.39 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.28 
 
 
487 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.2 
 
 
511 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.89 
 
 
529 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  34.26 
 
 
539 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  29.87 
 
 
557 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.02 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.5 
 
 
546 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  38.38 
 
 
533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.37 
 
 
527 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.22 
 
 
534 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  28.46 
 
 
523 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  38.41 
 
 
558 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.43 
 
 
620 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  28.34 
 
 
456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.48 
 
 
528 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  27.69 
 
 
577 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  27.92 
 
 
481 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.57 
 
 
558 aa  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.29 
 
 
548 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  33.99 
 
 
589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  26.42 
 
 
578 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  26.03 
 
 
581 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  25.78 
 
 
569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  40.21 
 
 
588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  38.07 
 
 
590 aa  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  25.26 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  25.88 
 
 
587 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  26.11 
 
 
497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  29.33 
 
 
580 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  33.91 
 
 
579 aa  110  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>