More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1022 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  100 
 
 		 578 aa  1188    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  47.49 
 
 		 579 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  47.7 
 
 		 590 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  45.09 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  46.43 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  45.11 
 
 		 578 aa  505  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  46.51 
 
 		 601 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  45.23 
 
 		 581 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  45.02 
 
 		 582 aa  495  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  43.77 
 
 		 569 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  45.16 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  45.81 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  44.73 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  44.73 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  44.73 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  44.75 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  44.19 
 
 		 587 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  43.08 
 
 		 574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  43.7 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  42.41 
 
 		 580 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  41.14 
 
 		 581 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  41.55 
 
 		 570 aa  458  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  41.57 
 
 		 577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  41.64 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  43.35 
 
 		 589 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  42.29 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  42.63 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  39.02 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  40.99 
 
 		 573 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  41.17 
 
 		 573 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  41.17 
 
 		 573 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  37.87 
 
 		 567 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  35.54 
 
 		 560 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  32.99 
 
 		 560 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 556 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 588 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  29.37 
 
 		 580 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 582 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 577 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.54 
 
 		 532 aa  134  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.74 
 
 		 545 aa  133  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  40.1 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.12 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.59 
 
 		 486 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.02 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  27.5 
 
 		 558 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  35.9 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.16 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  35.2 
 
 		 530 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.57 
 
 		 1076 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.95 
 
 		 532 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.28 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.44 
 
 		 493 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.03 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.62 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.88 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  34.69 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  38.19 
 
 		 534 aa  110  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  39.09 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  38 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.88 
 
 		 478 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.15 
 
 		 533 aa  107  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  32.99 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.18 
 
 		 651 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.2 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.87 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  34.36 
 
 		 504 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  24.71 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  22.26 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.04 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.87 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.87 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  24.29 
 
 		 534 aa  104  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.04 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  30.87 
 
 		 485 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.53 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.4 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  34.25 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.48 
 
 		 493 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.2 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  33.79 
 
 		 598 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  33.79 
 
 		 598 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.77 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  33.64 
 
 		 604 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.05 
 
 		 493 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.05 
 
 		 493 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  24.56 
 
 		 589 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.01 
 
 		 522 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  32.19 
 
 		 493 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  34.8 
 
 		 584 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.19 
 
 		 493 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.19 
 
 		 493 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.62 
 
 		 487 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  30.54 
 
 		 629 aa  98.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.56 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.19 
 
 		 493 aa  97.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.19 
 
 		 493 aa  97.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  33.5 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  33.5 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>