238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2680 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  55.56 
 
 		 569 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  56.37 
 
 		 582 aa  668    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  55 
 
 		 581 aa  651    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  100 
 
 		 579 aa  1188    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  52.51 
 
 		 578 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  51.11 
 
 		 587 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  49.47 
 
 		 583 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  51.96 
 
 		 586 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  49.14 
 
 		 601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  50.59 
 
 		 587 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  50.43 
 
 		 586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  48.53 
 
 		 579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  50.43 
 
 		 586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  50.43 
 
 		 586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  50.61 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  48.16 
 
 		 572 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  47.49 
 
 		 578 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  46.01 
 
 		 590 aa  538  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  45.77 
 
 		 577 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  47.54 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  48.08 
 
 		 574 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  50.26 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  45.5 
 
 		 574 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  46.33 
 
 		 580 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  44.39 
 
 		 578 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  46.49 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  46.58 
 
 		 573 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  46.58 
 
 		 573 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  46.76 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  44.01 
 
 		 581 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  44.82 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  42.61 
 
 		 567 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  35.7 
 
 		 560 aa  319  9e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  35.02 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  34.41 
 
 		 588 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  32.4 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  31.53 
 
 		 580 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.69 
 
 		 582 aa  193  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.15 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.55 
 
 		 529 aa  170  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  26.96 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.31 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.6 
 
 		 532 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.62 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  28.35 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.87 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.2 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.93 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  26.73 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  27.64 
 
 		 522 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.36 
 
 		 499 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  28.42 
 
 		 490 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  26.34 
 
 		 557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.25 
 
 		 534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  24.53 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  25.29 
 
 		 1076 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.03 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.08 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  24.96 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.61 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  27.39 
 
 		 558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.56 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.32 
 
 		 651 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  26.23 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.2 
 
 		 507 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  27.01 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  35.38 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  26.61 
 
 		 598 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  26.61 
 
 		 598 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  26.61 
 
 		 598 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  30.96 
 
 		 629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.2 
 
 		 491 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.57 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  24.11 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.08 
 
 		 493 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  34.69 
 
 		 504 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  34.69 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.57 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.91 
 
 		 493 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.53 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.57 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.91 
 
 		 493 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.57 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.32 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.42 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  34.5 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.28 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.17 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  36.08 
 
 		 493 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.08 
 
 		 493 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.08 
 
 		 493 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.04 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  36.41 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  28.85 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.4 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  34.17 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.57 
 
 		 491 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>