More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2023 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  100 
 
 		 579 aa  1156    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  54.29 
 
 		 580 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  55.75 
 
 		 578 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  55.09 
 
 		 589 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  53.33 
 
 		 572 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  53.77 
 
 		 573 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  53.59 
 
 		 573 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  53.77 
 
 		 573 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  53.24 
 
 		 575 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  53.79 
 
 		 581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  55.69 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  52.1 
 
 		 578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  52.45 
 
 		 574 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  50.61 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  50.26 
 
 		 570 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  52.26 
 
 		 577 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  49.83 
 
 		 583 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  50.26 
 
 		 574 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  49.82 
 
 		 581 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  48.89 
 
 		 590 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  48.95 
 
 		 569 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  49.24 
 
 		 586 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  46.89 
 
 		 587 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  46.94 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  46.94 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  46.94 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  45.9 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  46.19 
 
 		 587 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  43.48 
 
 		 582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  43.7 
 
 		 578 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  42.23 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  40.94 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  35.52 
 
 		 560 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  36.2 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.22 
 
 		 556 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  34.47 
 
 		 588 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  32.82 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  30.27 
 
 		 580 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.91 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  26.68 
 
 		 534 aa  148  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.68 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.07 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  28.31 
 
 		 611 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.5 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  28.55 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.4 
 
 		 545 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.08 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  25.76 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.89 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  24.57 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  43.65 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.15 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  29.28 
 
 		 587 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.51 
 
 		 487 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  27.4 
 
 		 522 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  27.42 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.86 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  27.63 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  27.63 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.36 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  26.97 
 
 		 485 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.89 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.25 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  25.26 
 
 		 1076 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.21 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  31.56 
 
 		 629 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.77 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.77 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.26 
 
 		 499 aa  120  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.77 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  24.8 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.2 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  27.38 
 
 		 604 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.51 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 533 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.33 
 
 		 491 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.65 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.33 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.13 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.86 
 
 		 532 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  38.46 
 
 		 486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.3 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  25.04 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.04 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.22 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  35.96 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  33.82 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  35.96 
 
 		 584 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  35.96 
 
 		 584 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  35.96 
 
 		 588 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  35.96 
 
 		 700 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  35.96 
 
 		 699 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  35.96 
 
 		 588 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.96 
 
 		 507 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  35.96 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.34 
 
 		 651 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  30.39 
 
 		 493 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  30.39 
 
 		 493 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  30.39 
 
 		 493 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  32.85 
 
 		 494 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>