More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1735 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  100 
 
 		 587 aa  1182    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  53.53 
 
 		 579 aa  636    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  51.11 
 
 		 579 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  49.83 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  47.95 
 
 		 581 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  49.23 
 
 		 586 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  48.29 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  49.23 
 
 		 586 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  49.23 
 
 		 586 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  49.15 
 
 		 587 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  49.32 
 
 		 586 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  46.6 
 
 		 582 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  47.12 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  44.82 
 
 		 583 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  46.89 
 
 		 579 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  45.14 
 
 		 575 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  43.99 
 
 		 574 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  45.56 
 
 		 574 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  44.19 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  45.23 
 
 		 580 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  42.64 
 
 		 601 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  43.97 
 
 		 590 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  42.43 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  42.96 
 
 		 581 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  46.45 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  43.34 
 
 		 589 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  42.76 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  42.74 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  42.74 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  42.74 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  41.19 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  44.27 
 
 		 567 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.93 
 
 		 560 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.84 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  34.64 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  34.76 
 
 		 588 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 580 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 577 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  29.87 
 
 		 582 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  29.47 
 
 		 530 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.21 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  30.29 
 
 		 533 aa  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  29.63 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.02 
 
 		 545 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.28 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.36 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.98 
 
 		 565 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  26.55 
 
 		 530 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.62 
 
 		 532 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.47 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  43.88 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  29.93 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  25.65 
 
 		 629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.26 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.18 
 
 		 534 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.03 
 
 		 491 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.5 
 
 		 1076 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  28.74 
 
 		 539 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.21 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  38.66 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.98 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.7 
 
 		 499 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  23.37 
 
 		 579 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.44 
 
 		 499 aa  120  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.64 
 
 		 478 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  25.65 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  26.68 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.09 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.03 
 
 		 487 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  25.48 
 
 		 598 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  37.88 
 
 		 486 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  28.43 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  26.59 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  25.48 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  25.48 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.12 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  37.63 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  37.63 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  37.63 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.9 
 
 		 651 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.12 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.12 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.12 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.07 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  27.31 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.68 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.67 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.16 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  37.63 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.88 
 
 		 488 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  35.2 
 
 		 485 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  36.18 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.84 
 
 		 525 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.88 
 
 		 507 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  40.82 
 
 		 490 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  34.69 
 
 		 504 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.76 
 
 		 848 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.69 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  33.84 
 
 		 589 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.05 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>