272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1348 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1287    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  33.02 
 
 		 611 aa  297  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  30.73 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  32.95 
 
 		 584 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  35.02 
 
 		 604 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  33.44 
 
 		 584 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  33.44 
 
 		 584 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  33.49 
 
 		 588 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  33.76 
 
 		 700 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  33.49 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  33.81 
 
 		 699 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  32.54 
 
 		 587 aa  273  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  33.54 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  33.54 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  33.39 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  34.7 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  34.91 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  25.73 
 
 		 587 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  32.02 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 580 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  30.72 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 575 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  32.12 
 
 		 577 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  31.75 
 
 		 566 aa  123  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 556 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  34.36 
 
 		 589 aa  120  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  30.67 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  34.64 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 567 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 579 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  31.22 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  37.2 
 
 		 573 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  37.2 
 
 		 573 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  37.2 
 
 		 573 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  32.49 
 
 		 578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  33.74 
 
 		 569 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  33.96 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  25.66 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  33.75 
 
 		 574 aa  112  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 601 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  31.09 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.14 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.93 
 
 		 533 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  32.13 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.16 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 582 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  25.71 
 
 		 581 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  32.48 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 578 aa  98.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.32 
 
 		 560 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  26.55 
 
 		 572 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  25.17 
 
 		 580 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.93 
 
 		 534 aa  94.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.42 
 
 		 499 aa  94.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  28.85 
 
 		 587 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.5 
 
 		 534 aa  91.3  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.34 
 
 		 484 aa  90.9  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  26.12 
 
 		 530 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  37.65 
 
 		 166 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.68 
 
 		 493 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  29.92 
 
 		 586 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 579 aa  89.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.34 
 
 		 499 aa  89.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.78 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  29.75 
 
 		 481 aa  89.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  24.18 
 
 		 589 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.33 
 
 		 480 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 		 486 aa  87  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.98 
 
 		 525 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.47 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.31 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  29.5 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.81 
 
 		 651 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.08 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  30.61 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.81 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.83 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  28.46 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  28.46 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  28.46 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  30.67 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.84 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.71 
 
 		 547 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.59 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  30 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  32 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.59 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.59 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  30 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  30 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.14 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  30.29 
 
 		 1076 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  31.5 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.84 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.58 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  30.81 
 
 		 493 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.31 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  25.2 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>