54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2936 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  68.93 
 
 
579 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  47.32 
 
 
584 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  48.78 
 
 
598 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  48.78 
 
 
598 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  48.78 
 
 
598 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  46.83 
 
 
700 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  49.51 
 
 
604 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  46.83 
 
 
584 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  46.83 
 
 
584 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  45.5 
 
 
699 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  45.93 
 
 
588 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  45.93 
 
 
588 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  48.06 
 
 
339 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  44.17 
 
 
587 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  44.17 
 
 
611 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  34.64 
 
 
629 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
560 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  29.32 
 
 
582 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.26 
 
 
560 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  28.5 
 
 
588 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  32.16 
 
 
556 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  30.17 
 
 
590 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.37 
 
 
565 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  28.64 
 
 
579 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.12 
 
 
527 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  28.86 
 
 
580 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  25.41 
 
 
534 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  28.85 
 
 
569 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.29 
 
 
528 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 
601 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  24.41 
 
 
422 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  29.57 
 
 
472 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  25.26 
 
 
577 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  23.12 
 
 
523 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.22 
 
 
422 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  25.56 
 
 
567 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  25.7 
 
 
581 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  25 
 
 
589 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  26.55 
 
 
422 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.22 
 
 
534 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.61 
 
 
522 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
587 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  44.74 
 
 
428 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  47.37 
 
 
428 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>