34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3313 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  88.79 
 
 
604 aa  614  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  80.24 
 
 
598 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  80.24 
 
 
598 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  79.94 
 
 
598 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  57.27 
 
 
700 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  56.5 
 
 
611 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  57.27 
 
 
584 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  57.27 
 
 
584 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  56.67 
 
 
584 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  56.59 
 
 
699 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  56.59 
 
 
588 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  56.59 
 
 
588 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  48.14 
 
 
579 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  52.68 
 
 
587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  48.06 
 
 
207 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  53.94 
 
 
166 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  59.09 
 
 
418 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  31.46 
 
 
629 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3208  hypothetical protein  61.02 
 
 
79 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  32.82 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.2 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  31.02 
 
 
577 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  30.49 
 
 
560 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  25.88 
 
 
582 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  26.03 
 
 
580 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.5 
 
 
493 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2565  putative metal dependent hydrolase  34.62 
 
 
466 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  24.42 
 
 
574 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.64 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  23.36 
 
 
575 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  29.35 
 
 
567 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  26.8 
 
 
534 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>