More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2565 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2565  putative metal dependent hydrolase  100 
 
 
466 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0675  amidohydrolase  45.99 
 
 
465 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0433934  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3843  amidohydrolase  45.38 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865403  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4530  amidohydrolase  44.03 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.27 
 
 
440 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  29.27 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  28.85 
 
 
441 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  28.85 
 
 
441 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.11 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  26.02 
 
 
468 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  24.54 
 
 
422 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  24.58 
 
 
422 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  28.23 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  24.34 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  23.74 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.47 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  26.33 
 
 
439 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.89 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  29.28 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  28.76 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  30.86 
 
 
432 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  25.82 
 
 
416 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  25.36 
 
 
447 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.66 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  24.4 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.57 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  25.26 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.57 
 
 
451 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.49 
 
 
433 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  22.99 
 
 
422 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  24.88 
 
 
458 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  23.21 
 
 
435 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  23.21 
 
 
435 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.55 
 
 
469 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  23.21 
 
 
435 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.8 
 
 
500 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.8 
 
 
476 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.8 
 
 
476 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  24.71 
 
 
428 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.53 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.43 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.43 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.65 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  24.1 
 
 
435 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  23.7 
 
 
430 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.13 
 
 
465 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.17 
 
 
449 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.84 
 
 
465 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  23.81 
 
 
435 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.79 
 
 
459 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.84 
 
 
465 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.39 
 
 
470 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.21 
 
 
470 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.44 
 
 
470 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.14 
 
 
439 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.67 
 
 
449 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  23.81 
 
 
441 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  23.81 
 
 
435 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  22.97 
 
 
435 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  22.97 
 
 
435 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.41 
 
 
441 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  26.73 
 
 
445 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.15 
 
 
431 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  23.81 
 
 
435 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.06 
 
 
454 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.11 
 
 
435 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.55 
 
 
465 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.35 
 
 
445 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.16 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.8 
 
 
451 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.67 
 
 
452 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.15 
 
 
449 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  22.3 
 
 
428 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1672  selenium metabolism protein SsnA  23.53 
 
 
442 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  23.09 
 
 
462 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.25 
 
 
441 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4106  amidohydrolase  26.15 
 
 
465 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.07 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0252  amidohydrolase  23.39 
 
 
427 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.99632  normal  0.114468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  27.07 
 
 
432 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.39 
 
 
457 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.41 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  23.4 
 
 
440 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.32 
 
 
446 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  25.81 
 
 
435 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  24.12 
 
 
444 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  21.48 
 
 
432 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.13 
 
 
451 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  28.57 
 
 
429 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.5 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.53 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.02 
 
 
452 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.28 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  25.18 
 
 
663 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.61 
 
 
444 aa  97.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  26.45 
 
 
440 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.36 
 
 
434 aa  96.7  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  25.47 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  25.23 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  26.02 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>