More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1906 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  74.42 
 
 
446 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.85 
 
 
446 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  100 
 
 
446 aa  899    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  68.15 
 
 
447 aa  571  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.38 
 
 
452 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.51 
 
 
465 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.28 
 
 
465 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.28 
 
 
457 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.91 
 
 
470 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.91 
 
 
470 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.91 
 
 
470 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.91 
 
 
470 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.01 
 
 
469 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.46 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.42 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.46 
 
 
470 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.21 
 
 
465 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.66 
 
 
465 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  60.28 
 
 
452 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  58.28 
 
 
461 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  58.48 
 
 
493 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  56.82 
 
 
476 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.05 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.05 
 
 
476 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.21 
 
 
470 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.51 
 
 
454 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  58.5 
 
 
467 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.96 
 
 
454 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.07 
 
 
472 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.29 
 
 
472 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.9 
 
 
460 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.29 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  49.89 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  48.15 
 
 
470 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  49.46 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  49.22 
 
 
503 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  44.04 
 
 
462 aa  388  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  42.38 
 
 
455 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.23 
 
 
453 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  49.32 
 
 
473 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.64 
 
 
458 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  49.43 
 
 
473 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.8 
 
 
450 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  52.28 
 
 
455 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.94 
 
 
459 aa  363  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  52.16 
 
 
457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  51.64 
 
 
457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.66 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  47.17 
 
 
443 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.32 
 
 
454 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.15 
 
 
449 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46 
 
 
459 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.04 
 
 
451 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.9 
 
 
449 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  45.95 
 
 
457 aa  349  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.98 
 
 
451 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.14 
 
 
451 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.9 
 
 
452 aa  341  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  49.88 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.61 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  49.51 
 
 
451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.48 
 
 
455 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.67 
 
 
461 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46 
 
 
458 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.15 
 
 
455 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.17 
 
 
452 aa  325  9e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.74 
 
 
451 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.54 
 
 
454 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.97 
 
 
454 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.39 
 
 
452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.39 
 
 
454 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  42.06 
 
 
449 aa  316  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  44.62 
 
 
464 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  41.65 
 
 
444 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  42.12 
 
 
461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  43.03 
 
 
460 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  39.78 
 
 
462 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  41.29 
 
 
460 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  37.59 
 
 
453 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  36.57 
 
 
452 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  39.82 
 
 
481 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  37.72 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  37.8 
 
 
476 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  34.82 
 
 
459 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  35.36 
 
 
459 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  32.81 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  33.18 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  32.72 
 
 
435 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  32.95 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  32.95 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  33.18 
 
 
435 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  32.72 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  32.72 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  32.72 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  32.72 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  32.49 
 
 
435 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.56 
 
 
441 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  34.13 
 
 
432 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  36.03 
 
 
429 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  33.67 
 
 
431 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>