More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3209 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  100 
 
 		 476 aa  958    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  90.13 
 
 		 476 aa  870    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  63.56 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  50.53 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  52.55 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  52.55 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  49.46 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  51.18 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  49.36 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  41.94 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.78 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.44 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.42 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.19 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.68 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.47 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.42 
 
 		 452 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.76 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.97 
 
 		 465 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.76 
 
 		 465 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.84 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  31.91 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38 
 
 		 470 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38 
 
 		 470 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38 
 
 		 470 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 470 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  39.96 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.34 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.76 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  38.44 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.96 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38 
 
 		 470 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.88 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.15 
 
 		 476 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.15 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.93 
 
 		 476 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.11 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.88 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  37.8 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.68 
 
 		 493 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.68 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.66 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.98 
 
 		 452 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.26 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.47 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.05 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.67 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.81 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.9 
 
 		 457 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.87 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.96 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.02 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.32 
 
 		 474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.04 
 
 		 448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.28 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.93 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  36.3 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.62 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.8 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.17 
 
 		 472 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.44 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  39.05 
 
 		 457 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.32 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.9 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  31.99 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.7 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  35.91 
 
 		 464 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  36.15 
 
 		 473 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.04 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.53 
 
 		 467 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  34.63 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.43 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  33.71 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  33.41 
 
 		 459 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  32.47 
 
 		 459 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.59 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  34.38 
 
 		 473 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.34 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  33.11 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  36.54 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  34.26 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  31.77 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  32.41 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  34.86 
 
 		 432 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  28.38 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.37 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  31.37 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.75 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.38 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  31.65 
 
 		 429 aa  154  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  30.2 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.31 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  29.5 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  29.61 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.25 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.08 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.26 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>