More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2016 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  100 
 
 
481 aa  970    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  64.53 
 
 
476 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  63.56 
 
 
476 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  50.31 
 
 
464 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  50.64 
 
 
460 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  50.42 
 
 
460 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  47.58 
 
 
461 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  47.22 
 
 
453 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  45.55 
 
 
462 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  42.92 
 
 
452 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.71 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  32.21 
 
 
462 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.05 
 
 
446 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.06 
 
 
453 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.08 
 
 
458 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.74 
 
 
460 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.71 
 
 
451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.71 
 
 
454 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.82 
 
 
446 aa  251  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  36.01 
 
 
473 aa  250  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.9 
 
 
451 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.38 
 
 
469 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.79 
 
 
470 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.35 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.37 
 
 
470 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.42 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.12 
 
 
493 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.43 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  39.39 
 
 
451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.46 
 
 
458 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.7 
 
 
449 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.37 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.37 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.37 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.1 
 
 
465 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.1 
 
 
465 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.02 
 
 
452 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.16 
 
 
470 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.37 
 
 
470 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  39.13 
 
 
457 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.31 
 
 
457 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.16 
 
 
470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.32 
 
 
455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  39.71 
 
 
453 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.29 
 
 
455 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.72 
 
 
465 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  34.52 
 
 
464 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.96 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.12 
 
 
500 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.73 
 
 
476 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.81 
 
 
449 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.62 
 
 
454 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.94 
 
 
454 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.89 
 
 
467 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.32 
 
 
452 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.5 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.67 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  34.31 
 
 
464 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.13 
 
 
448 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.92 
 
 
450 aa  233  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.19 
 
 
446 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.54 
 
 
472 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 
459 aa  230  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.43 
 
 
452 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.47 
 
 
454 aa  230  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.06 
 
 
461 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.47 
 
 
454 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.43 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.02 
 
 
454 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  34.22 
 
 
457 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  29.96 
 
 
455 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.26 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.36 
 
 
455 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  36.26 
 
 
503 aa  216  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  40.45 
 
 
457 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  32.98 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.65 
 
 
459 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.6 
 
 
452 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  36.34 
 
 
473 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  35.33 
 
 
443 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  32.71 
 
 
459 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.36 
 
 
451 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  33.56 
 
 
459 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  33.68 
 
 
449 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  32.77 
 
 
444 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  31.42 
 
 
430 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  26.75 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  31.52 
 
 
444 aa  153  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  33.59 
 
 
432 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  32.85 
 
 
429 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  29.98 
 
 
428 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.88 
 
 
441 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.57 
 
 
431 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.96 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.78 
 
 
431 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  25.73 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  30.2 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  30.6 
 
 
434 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  29.35 
 
 
466 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  22.46 
 
 
428 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>