More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2119 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  75.66 
 
 		 465 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.21 
 
 		 465 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  100 
 
 		 474 aa  956    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 		 470 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.34 
 
 		 470 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.55 
 
 		 470 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  90.54 
 
 		 472 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  77.01 
 
 		 493 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 		 476 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.21 
 
 		 465 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.57 
 
 		 452 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.98 
 
 		 470 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  74.14 
 
 		 452 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  90.54 
 
 		 472 aa  863    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 		 470 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  75.88 
 
 		 461 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  74.09 
 
 		 465 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  78.31 
 
 		 467 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 		 470 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 		 470 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 		 470 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.74 
 
 		 454 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  74.12 
 
 		 469 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.43 
 
 		 457 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.67 
 
 		 460 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.9 
 
 		 476 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.9 
 
 		 500 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  68.42 
 
 		 454 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  63.45 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.22 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  62.09 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.29 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  55.8 
 
 		 470 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  53.13 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  52.92 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.52 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.27 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  42.18 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.5 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  47.79 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.91 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  41.82 
 
 		 462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.81 
 
 		 453 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.94 
 
 		 451 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  46.56 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.48 
 
 		 451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  46.53 
 
 		 473 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.35 
 
 		 451 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.19 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  44.35 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.53 
 
 		 452 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.91 
 
 		 455 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.22 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.05 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.05 
 
 		 455 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.05 
 
 		 449 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  46.8 
 
 		 457 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  50.63 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.31 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  43.78 
 
 		 449 aa  339  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  50.53 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  49.31 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.5 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.09 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.43 
 
 		 455 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.01 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  44.88 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.77 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.99 
 
 		 448 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.96 
 
 		 454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.2 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.44 
 
 		 451 aa  308  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  38.82 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  43.54 
 
 		 460 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  42.07 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  38.64 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  40.89 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  39.95 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  40.31 
 
 		 464 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  38.67 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  39.2 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  37.32 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  38.5 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  36.53 
 
 		 476 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  37.26 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  36.09 
 
 		 439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  33.11 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  36 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.24 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  33.59 
 
 		 431 aa  203  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  34.75 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.29 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.29 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  31.28 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.11 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  36.29 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  30.1 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  28.05 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.11 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  31.18 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>