More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3513 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  100 
 
 
449 aa  917    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  59.17 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  57.67 
 
 
473 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  54.79 
 
 
503 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  55.9 
 
 
457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.86 
 
 
469 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.21 
 
 
452 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.72 
 
 
465 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  43.05 
 
 
462 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.27 
 
 
457 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.94 
 
 
465 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.04 
 
 
465 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.82 
 
 
465 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.69 
 
 
454 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.98 
 
 
470 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.96 
 
 
461 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.98 
 
 
470 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.3 
 
 
452 aa  363  4e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.98 
 
 
470 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.98 
 
 
470 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.98 
 
 
470 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.99 
 
 
470 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.7 
 
 
470 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.92 
 
 
500 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  41.74 
 
 
455 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.92 
 
 
476 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.7 
 
 
476 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.75 
 
 
470 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  43.9 
 
 
464 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.25 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  44.25 
 
 
464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.74 
 
 
493 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.28 
 
 
452 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.37 
 
 
472 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.91 
 
 
472 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.91 
 
 
447 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.27 
 
 
454 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  43.04 
 
 
470 aa  349  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.19 
 
 
454 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.48 
 
 
449 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.91 
 
 
454 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.32 
 
 
454 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.21 
 
 
449 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.82 
 
 
454 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.56 
 
 
448 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.01 
 
 
458 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.62 
 
 
461 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.76 
 
 
467 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  44.26 
 
 
451 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.78 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.82 
 
 
452 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.36 
 
 
452 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.59 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.44 
 
 
451 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.57 
 
 
455 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.19 
 
 
455 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.99 
 
 
451 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.32 
 
 
446 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.72 
 
 
458 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.47 
 
 
452 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.93 
 
 
446 aa  332  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.42 
 
 
450 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.18 
 
 
459 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.82 
 
 
453 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  42.49 
 
 
457 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  44.14 
 
 
457 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.7 
 
 
459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.06 
 
 
446 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  43.5 
 
 
453 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  41.69 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.53 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.1 
 
 
451 aa  296  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  36.32 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  33.67 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  34.02 
 
 
459 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  34.42 
 
 
460 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  33.99 
 
 
453 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  33.8 
 
 
460 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  33.94 
 
 
462 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  32.52 
 
 
461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  30.77 
 
 
452 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  34.28 
 
 
464 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  33.68 
 
 
481 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  34.58 
 
 
439 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  32.41 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  31.63 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.21 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.12 
 
 
441 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  30.49 
 
 
430 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  32.56 
 
 
440 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  32.08 
 
 
442 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  28.15 
 
 
431 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  32.75 
 
 
440 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.96 
 
 
432 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  30.84 
 
 
445 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  27.65 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  30.53 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  26.92 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  28.08 
 
 
426 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  26.98 
 
 
435 aa  152  8e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>