More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3434 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  70.93 
 
 		 460 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  100 
 
 		 462 aa  946    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  70.77 
 
 		 460 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  72.37 
 
 		 461 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  65.86 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  52.74 
 
 		 476 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  50.53 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  48 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  45.55 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  48.24 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.08 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.79 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.96 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.74 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  36.21 
 
 		 455 aa  289  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.05 
 
 		 465 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.04 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.12 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.8 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.62 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.1 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.06 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.39 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.39 
 
 		 451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.62 
 
 		 476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.31 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.06 
 
 		 469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.39 
 
 		 470 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.89 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.95 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.7 
 
 		 472 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.61 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.05 
 
 		 461 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.46 
 
 		 472 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 470 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 470 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.61 
 
 		 470 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.15 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.04 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.56 
 
 		 447 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.78 
 
 		 446 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  34.43 
 
 		 462 aa  269  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.53 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.32 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.64 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.76 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.48 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.85 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.09 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.03 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.61 
 
 		 454 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.07 
 
 		 453 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.57 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.75 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.67 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.42 
 
 		 454 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.86 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.2 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  40.1 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  39.02 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  38.07 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.39 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  36.77 
 
 		 464 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.34 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.21 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  37.56 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  36.43 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  35.92 
 
 		 503 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  36.46 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  38.63 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.54 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  34.96 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  33.88 
 
 		 473 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  36.54 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.74 
 
 		 459 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  35.25 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.32 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  33.94 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  31.13 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  30.96 
 
 		 459 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  33.68 
 
 		 432 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  32.42 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  31.23 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  28.12 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  32.33 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  28.81 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  29.93 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  29.93 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  29.93 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  29.93 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  29.93 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.51 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  29.69 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  28.64 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  29.69 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>