More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1140 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.58 
 
 		 465 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.74 
 
 		 474 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.02 
 
 		 457 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.68 
 
 		 452 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.8 
 
 		 476 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.91 
 
 		 470 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.46 
 
 		 472 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  100 
 
 		 454 aa  922    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.71 
 
 		 452 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.54 
 
 		 470 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  68.81 
 
 		 465 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.8 
 
 		 467 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.13 
 
 		 470 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.58 
 
 		 465 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.68 
 
 		 472 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.91 
 
 		 470 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.13 
 
 		 470 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.35 
 
 		 470 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  68.85 
 
 		 461 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  79.21 
 
 		 460 aa  735    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.25 
 
 		 465 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.58 
 
 		 476 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.58 
 
 		 500 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  67.61 
 
 		 493 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.91 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.69 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  67.04 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  65.48 
 
 		 454 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  58.89 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  58.41 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.58 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  56.43 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  56.64 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.51 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  52.85 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  45.1 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.85 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.02 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  47.23 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  44.32 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.39 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  49.09 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.96 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.93 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.42 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.34 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.24 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.8 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.91 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.91 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  46.53 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.57 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.92 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.85 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  44.49 
 
 		 443 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  45.34 
 
 		 473 aa  356  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  43.27 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  46.58 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.76 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  44.16 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.84 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.21 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  47.66 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.64 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.84 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.42 
 
 		 448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.54 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.69 
 
 		 454 aa  333  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.69 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  47.3 
 
 		 457 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.35 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  44.1 
 
 		 457 aa  319  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  41.08 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  40.04 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  42.62 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  40.79 
 
 		 444 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  37.66 
 
 		 464 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  40.35 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  37.25 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  38.78 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  36.71 
 
 		 481 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  34.59 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  36.96 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  37.32 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  36.38 
 
 		 476 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.07 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  34.95 
 
 		 430 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.93 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  31.51 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  30.21 
 
 		 431 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  35.8 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.35 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  35.73 
 
 		 663 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  32.65 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  34.15 
 
 		 439 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  32.42 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  32.42 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  32.42 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  30.91 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  32.42 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>