More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2587 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  90.13 
 
 		 476 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  100 
 
 		 476 aa  956    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  64.53 
 
 		 481 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  52.74 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  53.09 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  52.67 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  50.11 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  49.89 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  49.89 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  42.8 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.91 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.27 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.78 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  40.96 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.13 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  33.18 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.94 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.76 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.12 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.86 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.55 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.87 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  38.75 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.26 
 
 		 452 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.87 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.47 
 
 		 470 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.47 
 
 		 470 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.47 
 
 		 470 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.02 
 
 		 461 aa  249  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.21 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.01 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.84 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.47 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.24 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.87 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.3 
 
 		 470 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  38.31 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.88 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.24 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  38.46 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.93 
 
 		 454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.79 
 
 		 461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  37.32 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.36 
 
 		 476 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  38.39 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.35 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.36 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.14 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.08 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.03 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.31 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.53 
 
 		 452 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.72 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  31.78 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.38 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.88 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.1 
 
 		 454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.38 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.63 
 
 		 493 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.85 
 
 		 457 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.07 
 
 		 465 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  34.51 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.61 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.1 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.85 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.38 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.37 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.53 
 
 		 474 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.14 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  34.43 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  33.33 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  34.18 
 
 		 464 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36.21 
 
 		 467 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  35.43 
 
 		 503 aa  216  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.9 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.8 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  32.97 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  32.11 
 
 		 459 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  37.84 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  34.52 
 
 		 473 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  34.19 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  37.74 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  32.89 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  31.91 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  31.63 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  28.27 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  34.38 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.84 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  33.15 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  30.56 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  28.15 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  31.51 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.25 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.97 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  29.93 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.63 
 
 		 431 aa  146  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.34 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.42 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.25 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>