More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0197 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  76.01 
 
 
473 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  75.38 
 
 
503 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  100 
 
 
457 aa  896    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  70.16 
 
 
443 aa  601  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  55.9 
 
 
449 aa  475  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.78 
 
 
452 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.12 
 
 
450 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.97 
 
 
451 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50 
 
 
451 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.71 
 
 
451 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.7 
 
 
453 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  52.22 
 
 
452 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.58 
 
 
446 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.59 
 
 
458 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  54.27 
 
 
458 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.64 
 
 
448 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.25 
 
 
470 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.29 
 
 
446 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.59 
 
 
447 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  50.59 
 
 
473 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  54.33 
 
 
455 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.89 
 
 
465 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.89 
 
 
465 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.59 
 
 
449 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  53.53 
 
 
451 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  52.48 
 
 
455 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.62 
 
 
470 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.85 
 
 
470 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.1 
 
 
452 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.21 
 
 
461 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.12 
 
 
476 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.62 
 
 
470 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  52.04 
 
 
452 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.62 
 
 
470 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.62 
 
 
470 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  49.88 
 
 
449 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.62 
 
 
470 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.62 
 
 
470 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.61 
 
 
454 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.89 
 
 
476 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.89 
 
 
500 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.74 
 
 
452 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.36 
 
 
452 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.86 
 
 
454 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.2 
 
 
469 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  52.14 
 
 
455 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50.61 
 
 
454 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.87 
 
 
457 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.4 
 
 
459 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  51.57 
 
 
457 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  46.04 
 
 
464 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.84 
 
 
465 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  41.41 
 
 
462 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  45.82 
 
 
464 aa  362  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.74 
 
 
446 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.6 
 
 
465 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  45.75 
 
 
470 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.13 
 
 
472 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.42 
 
 
454 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  50 
 
 
454 aa  359  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  49.18 
 
 
453 aa  358  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.35 
 
 
461 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.47 
 
 
472 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  47.32 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.81 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.25 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.58 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.53 
 
 
474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  38.79 
 
 
455 aa  352  8.999999999999999e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.1 
 
 
454 aa  349  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.32 
 
 
467 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.77 
 
 
459 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  42.02 
 
 
444 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  38.63 
 
 
462 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  40.33 
 
 
460 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  37.22 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  36.81 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  39.34 
 
 
460 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  36.61 
 
 
461 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  39.39 
 
 
464 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  38.21 
 
 
481 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  37.74 
 
 
476 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  35.66 
 
 
476 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  33.75 
 
 
459 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  33.5 
 
 
459 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  33.48 
 
 
440 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  33.19 
 
 
447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.74 
 
 
441 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  31.66 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  29.78 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  33.8 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  28.21 
 
 
431 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  34.25 
 
 
483 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  30.17 
 
 
442 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  30.93 
 
 
431 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  33.07 
 
 
430 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  32.94 
 
 
483 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  29.1 
 
 
431 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  28.33 
 
 
422 aa  156  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  34.83 
 
 
428 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>