More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2259 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  75.88 
 
 
465 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  73.68 
 
 
452 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  77.41 
 
 
461 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.79 
 
 
465 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  100 
 
 
472 aa  961    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  90.54 
 
 
474 aa  863    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  99.15 
 
 
472 aa  954    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  73.67 
 
 
452 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  78.04 
 
 
493 aa  740    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.87 
 
 
476 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.21 
 
 
470 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.87 
 
 
470 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  73.68 
 
 
469 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.87 
 
 
470 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  75.22 
 
 
465 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  79.61 
 
 
467 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.43 
 
 
470 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.43 
 
 
470 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.68 
 
 
454 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  73.09 
 
 
500 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.43 
 
 
470 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.37 
 
 
457 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.79 
 
 
465 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.43 
 
 
470 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.46 
 
 
460 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.65 
 
 
470 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  73.09 
 
 
476 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  68.42 
 
 
454 aa  631  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  63.22 
 
 
447 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.05 
 
 
446 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  57.6 
 
 
446 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  55.07 
 
 
446 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  56.24 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  53.35 
 
 
464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  52.92 
 
 
464 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.38 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  42.86 
 
 
455 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.76 
 
 
459 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.05 
 
 
452 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.2 
 
 
453 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  46.68 
 
 
503 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.54 
 
 
450 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  42.86 
 
 
462 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.16 
 
 
451 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  47 
 
 
473 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.48 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.6 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.34 
 
 
455 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.18 
 
 
449 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.12 
 
 
449 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.37 
 
 
461 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  45.41 
 
 
473 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.91 
 
 
454 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  51.14 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  50.26 
 
 
451 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.48 
 
 
458 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  45.37 
 
 
449 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  41.84 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  43.02 
 
 
443 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  46.35 
 
 
457 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  47.8 
 
 
453 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.75 
 
 
455 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.91 
 
 
459 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.72 
 
 
455 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.01 
 
 
452 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.01 
 
 
452 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  44.47 
 
 
457 aa  336  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.07 
 
 
454 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.73 
 
 
448 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  48.84 
 
 
451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.92 
 
 
454 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.46 
 
 
454 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  43.36 
 
 
460 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  38.38 
 
 
461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  38.7 
 
 
462 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  41.81 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  40.9 
 
 
444 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  40.41 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  39.36 
 
 
452 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  37.5 
 
 
459 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  38.02 
 
 
459 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  37.65 
 
 
453 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  35.68 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  36.67 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  35.38 
 
 
476 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  35.71 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  36.55 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  32.14 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.66 
 
 
484 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.66 
 
 
451 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  31.86 
 
 
431 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  29.03 
 
 
434 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.26 
 
 
441 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.89 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.15 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  33.33 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  35.21 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  29.49 
 
 
422 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  33.03 
 
 
447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  34.69 
 
 
663 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>