More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3843 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3843  amidohydrolase  100 
 
 		 466 aa  930    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0675  amidohydrolase  74.89 
 
 		 465 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0433934  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4530  amidohydrolase  61.74 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2565  putative metal dependent hydrolase  45.38 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  29.48 
 
 		 441 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  29.48 
 
 		 441 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  29.14 
 
 		 441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.42 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  26.57 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.21 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.06 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  26.09 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.21 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.89 
 
 		 444 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  27.75 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.85 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.19 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1494  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  27.76 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  23.44 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.49 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  28.03 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  28.82 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.73 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  28.22 
 
 		 458 aa  123  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.97 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.24 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  26.23 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.49 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.24 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  26.33 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  28.28 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.59 
 
 		 451 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25.06 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.46 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1672  selenium metabolism protein SsnA  27.36 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.98 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.81 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25.45 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  25.06 
 
 		 426 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  26.75 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.21 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.96 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1737  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  26.38 
 
 		 443 aa  110  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 		 464 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  24.03 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  25.24 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  23.79 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  23.79 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  23.79 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.12 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.84 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.67 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.86 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  25.24 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.64 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  28.18 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.45 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  24.25 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.07 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  24.61 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.29 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.08 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.86 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  27.64 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25.39 
 
 		 435 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  25.39 
 
 		 435 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.61 
 
 		 435 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.13 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.44 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  27.6 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.4 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  27.78 
 
 		 442 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.23 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0654  amidohydrolase  23.15 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  25.57 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.91 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.85 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.33 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  25.78 
 
 		 509 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.21 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.8 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  28.92 
 
 		 445 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.83 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  28.39 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.23 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.54 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  28.13 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  25.32 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.29 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.82 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  24.94 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  27.11 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.96 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.83 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>