More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2960 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  100 
 
 
458 aa  932    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  47.02 
 
 
447 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  40.9 
 
 
432 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  44.6 
 
 
439 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  39.58 
 
 
434 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  41 
 
 
663 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  41.23 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  40.52 
 
 
440 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  41.2 
 
 
442 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  41.88 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  41 
 
 
663 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  38.6 
 
 
660 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  40.79 
 
 
656 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.67 
 
 
432 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  37.06 
 
 
468 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  40.9 
 
 
440 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  40.05 
 
 
430 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  38.64 
 
 
431 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  35.73 
 
 
469 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.71 
 
 
442 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  39.58 
 
 
434 aa  293  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.21 
 
 
484 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.21 
 
 
451 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.56 
 
 
434 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  37.15 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  36.41 
 
 
431 aa  282  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  40.93 
 
 
445 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  39.27 
 
 
428 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  39.76 
 
 
431 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  36.89 
 
 
431 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  37.09 
 
 
440 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  42.63 
 
 
444 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  34.92 
 
 
422 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  35.39 
 
 
422 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  35.63 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.15 
 
 
444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.45 
 
 
444 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.41 
 
 
448 aa  273  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  40.15 
 
 
432 aa  272  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.81 
 
 
455 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  35.39 
 
 
422 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.21 
 
 
449 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.68 
 
 
444 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  35.75 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  39.22 
 
 
443 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.42 
 
 
441 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  33.18 
 
 
431 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  41.39 
 
 
416 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  38.8 
 
 
425 aa  268  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.03 
 
 
447 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  34.86 
 
 
444 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  41.95 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.79 
 
 
447 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  38.92 
 
 
441 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  38.92 
 
 
441 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  40.69 
 
 
429 aa  263  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.56 
 
 
442 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  37.05 
 
 
440 aa  262  8e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  36.32 
 
 
435 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0654  amidohydrolase  36.97 
 
 
423 aa  262  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  36.32 
 
 
435 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  36.32 
 
 
435 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  36.08 
 
 
435 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  36.08 
 
 
435 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  39.18 
 
 
449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  36.08 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  35.85 
 
 
435 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.18 
 
 
441 aa  259  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  35.85 
 
 
435 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  34.24 
 
 
436 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.7 
 
 
443 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.84 
 
 
442 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  35.85 
 
 
435 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  35.85 
 
 
435 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1376  amidohydrolase  37.34 
 
 
427 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000571224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  35.14 
 
 
435 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.74 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0532  amidohydrolase  36.81 
 
 
427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  41.64 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  40.33 
 
 
439 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  35.65 
 
 
435 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  39.52 
 
 
432 aa  252  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1366  amidohydrolase  33.41 
 
 
459 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.376571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  34.31 
 
 
428 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  41.99 
 
 
438 aa  250  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1645  amidohydrolase  42.2 
 
 
438 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  33.02 
 
 
435 aa  249  7e-65  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  40.33 
 
 
432 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.17 
 
 
439 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  38.27 
 
 
421 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1260  amidohydrolase  35.93 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  37.84 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.64 
 
 
444 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.96 
 
 
446 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  36.89 
 
 
413 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.08 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  36.7 
 
 
445 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  36.72 
 
 
433 aa  236  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  34.63 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  36.6 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>