More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0675 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3843  amidohydrolase  74.89 
 
 
466 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865403  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0675  amidohydrolase  100 
 
 
465 aa  931    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0433934  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4530  amidohydrolase  62.75 
 
 
488 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2565  putative metal dependent hydrolase  45.99 
 
 
466 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  30.75 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  31.22 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  30.75 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1672  selenium metabolism protein SsnA  26.01 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.02 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1494  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  26.12 
 
 
445 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.46 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.48 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.5 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  26.64 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  27.12 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  28.19 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.54 
 
 
428 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1737  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  28.01 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.54 
 
 
469 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  24.88 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.34 
 
 
444 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.23 
 
 
422 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  29.97 
 
 
426 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.75 
 
 
449 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  28.64 
 
 
477 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.83 
 
 
433 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.64 
 
 
441 aa  123  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.25 
 
 
484 aa  123  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.97 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2655  selenium metabolism protein SsnA  23.71 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.23 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.09 
 
 
430 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.18 
 
 
444 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  24.77 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.97 
 
 
449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  26.73 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  24.94 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  28.88 
 
 
432 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  25.24 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.27 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  28.77 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.67 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  26.9 
 
 
439 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  24.13 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  26.38 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  30.3 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.39 
 
 
431 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.53 
 
 
449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  28.51 
 
 
464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  30.09 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  27.52 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  27.63 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.57 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.19 
 
 
440 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  21.84 
 
 
428 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  28.37 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  24.21 
 
 
426 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.48 
 
 
431 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  27.58 
 
 
442 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  28.07 
 
 
656 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.76 
 
 
442 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25.19 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.96 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  25.87 
 
 
509 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.29 
 
 
454 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.07 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.71 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  28.7 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.64 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0422  selenium metabolism protein SsnA  27.67 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  28.03 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.34 
 
 
451 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.45 
 
 
432 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  26.7 
 
 
466 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.06 
 
 
447 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25.19 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.96 
 
 
476 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  25.12 
 
 
440 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.4 
 
 
445 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.06 
 
 
447 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.96 
 
 
500 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.96 
 
 
476 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.12 
 
 
448 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.23 
 
 
445 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  26.54 
 
 
443 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  25.69 
 
 
435 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.21 
 
 
470 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.4 
 
 
431 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  27.68 
 
 
479 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.69 
 
 
435 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.29 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  25 
 
 
464 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.21 
 
 
470 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.97 
 
 
470 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.21 
 
 
470 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25.69 
 
 
441 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  26.46 
 
 
443 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.97 
 
 
470 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27 
 
 
458 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.44 
 
 
435 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>