More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5431 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2068  amidohydrolase  68.94 
 
 
460 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  100 
 
 
466 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1235  amidohydrolase  69.82 
 
 
460 aa  631  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0610028  normal  0.415646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  59.68 
 
 
461 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  38.88 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  35.43 
 
 
431 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  36.56 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  35.06 
 
 
434 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  36.89 
 
 
440 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.54 
 
 
432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  37.5 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  36.92 
 
 
440 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  36.51 
 
 
442 aa  243  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  34.16 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  34.98 
 
 
431 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  35.75 
 
 
447 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  33.56 
 
 
435 aa  231  2e-59  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  36.36 
 
 
440 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  36.56 
 
 
428 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.95 
 
 
434 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  33.56 
 
 
431 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  32.37 
 
 
431 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  37.47 
 
 
442 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.17 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  33.26 
 
 
434 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  31.92 
 
 
428 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.5 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.05 
 
 
484 aa  213  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.05 
 
 
451 aa  213  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.59 
 
 
439 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  32.94 
 
 
436 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  34.1 
 
 
458 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  31.23 
 
 
422 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  31.94 
 
 
440 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  35.78 
 
 
434 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  32.47 
 
 
426 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.12 
 
 
436 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  33.96 
 
 
435 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  37.08 
 
 
432 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  30.98 
 
 
422 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  31.9 
 
 
455 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  30.95 
 
 
422 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  34.04 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  32.48 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  32.71 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  32.71 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  32.48 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  32.48 
 
 
435 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  31.79 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  33.18 
 
 
441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.27 
 
 
441 aa  200  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  32.94 
 
 
435 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  32.53 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  32.71 
 
 
435 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  30.12 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  32.8 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  35.64 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  32.48 
 
 
435 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  33.49 
 
 
422 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.13 
 
 
445 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  33.02 
 
 
656 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  33 
 
 
455 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.35 
 
 
444 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
464 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  35.81 
 
 
444 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  32.09 
 
 
660 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  28.06 
 
 
444 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.69 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  36.34 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  33.17 
 
 
435 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  33.49 
 
 
438 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  34.35 
 
 
435 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  32.85 
 
 
433 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.25 
 
 
449 aa  186  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  34.31 
 
 
434 aa  186  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  32.88 
 
 
416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  30.5 
 
 
478 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  33.18 
 
 
663 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  33.79 
 
 
474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.59 
 
 
439 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.06 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  35.83 
 
 
426 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  34.04 
 
 
445 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  31.71 
 
 
468 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.74 
 
 
446 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.01 
 
 
444 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  32.41 
 
 
473 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  34.08 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  31.02 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  33.33 
 
 
663 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.75 
 
 
442 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.88 
 
 
448 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1645  amidohydrolase  34.57 
 
 
438 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  33.33 
 
 
447 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.75 
 
 
441 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  30.07 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.44 
 
 
469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  31.18 
 
 
443 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  32.02 
 
 
432 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  31.43 
 
 
441 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>