More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4106 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4106  amidohydrolase  100 
 
 
465 aa  942    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  41.42 
 
 
483 aa  299  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  30.59 
 
 
432 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  31.08 
 
 
447 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  29.48 
 
 
435 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.38 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.38 
 
 
484 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  31.54 
 
 
440 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.19 
 
 
448 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  28.67 
 
 
435 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  30.73 
 
 
439 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  28.8 
 
 
435 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  28.8 
 
 
435 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  28.34 
 
 
435 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  28.34 
 
 
435 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  28.34 
 
 
435 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  31.06 
 
 
428 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  28.34 
 
 
435 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  28.34 
 
 
435 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  28.34 
 
 
435 aa  156  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  27.05 
 
 
660 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  28.34 
 
 
441 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  28.28 
 
 
469 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.83 
 
 
441 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  27.89 
 
 
435 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  30.77 
 
 
461 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  29.29 
 
 
398 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  29.18 
 
 
656 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  29.37 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.71 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.9 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  30.48 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.71 
 
 
431 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  28.07 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  30 
 
 
430 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.42 
 
 
434 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.26 
 
 
439 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.5 
 
 
431 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.96 
 
 
663 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.51 
 
 
452 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.5 
 
 
431 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  28.57 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.67 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.34 
 
 
454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.61 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  30.23 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.08 
 
 
460 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.28 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.84 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  29.72 
 
 
441 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.08 
 
 
441 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 
470 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  29.72 
 
 
441 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.72 
 
 
433 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  30 
 
 
439 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30 
 
 
476 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  29.05 
 
 
663 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 
500 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 
476 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  24.94 
 
 
428 aa  137  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  30.66 
 
 
437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  27.88 
 
 
426 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.24 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  25.63 
 
 
444 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.66 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.35 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  27.07 
 
 
458 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.84 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  30.38 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.65 
 
 
438 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.84 
 
 
422 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  28.16 
 
 
443 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  31.69 
 
 
473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.61 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.57 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  29.13 
 
 
474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  29.73 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29 
 
 
493 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.52 
 
 
441 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  26.94 
 
 
464 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  24.78 
 
 
436 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.71 
 
 
461 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.83 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.56 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.31 
 
 
447 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  26.82 
 
 
464 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.93 
 
 
449 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.09 
 
 
447 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  31.52 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.41 
 
 
469 aa  127  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.89 
 
 
428 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.83 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  28.4 
 
 
457 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  26.62 
 
 
462 aa  126  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  27.65 
 
 
466 aa  126  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  27.95 
 
 
457 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.74 
 
 
465 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.11 
 
 
445 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.31 
 
 
447 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>