More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3631 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  71.36 
 
 		 582 aa  872    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  100 
 
 		 580 aa  1202    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 579 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  32 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 583 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  29.4 
 
 		 581 aa  210  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 587 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  30.19 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  29.59 
 
 		 569 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  29 
 
 		 581 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 580 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 578 aa  200  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  28.62 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  29.01 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  29.73 
 
 		 586 aa  198  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 578 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  28.74 
 
 		 601 aa  197  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 577 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 567 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  29.54 
 
 		 575 aa  193  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 574 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  27.62 
 
 		 574 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  28.55 
 
 		 579 aa  180  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  26.82 
 
 		 590 aa  178  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 577 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  37.27 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.18 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.12 
 
 		 530 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  37.25 
 
 		 589 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.16 
 
 		 533 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.01 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.91 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  27.05 
 
 		 533 aa  144  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  37.17 
 
 		 566 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  40.8 
 
 		 582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  26.86 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  27.98 
 
 		 611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.73 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  38.53 
 
 		 586 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  38.53 
 
 		 586 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  38.53 
 
 		 586 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.85 
 
 		 547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.79 
 
 		 494 aa  126  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.47 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.64 
 
 		 477 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.59 
 
 		 534 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  25.9 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  25.9 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  26.06 
 
 		 700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  27.46 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  25.82 
 
 		 588 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  25.08 
 
 		 589 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  25.82 
 
 		 588 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  28.84 
 
 		 558 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  25.82 
 
 		 699 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  25.84 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  25.73 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  38.07 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  35.45 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.5 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  25.04 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  37.62 
 
 		 485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.46 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.98 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.18 
 
 		 491 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.38 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.47 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  34.16 
 
 		 504 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.74 
 
 		 493 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  24.2 
 
 		 579 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.33 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.33 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.56 
 
 		 493 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.21 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.91 
 
 		 507 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.21 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.37 
 
 		 484 aa  107  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.5 
 
 		 499 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  34.73 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.91 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.34 
 
 		 1076 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.58 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  30.41 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.33 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.21 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  27.04 
 
 		 557 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  29.29 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.07 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.29 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.29 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.98 
 
 		 487 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.02 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.07 
 
 		 478 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>