197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1900 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  100 
 
 
589 aa  1224    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  32.53 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.11 
 
 
528 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.58 
 
 
533 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.23 
 
 
534 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  29.42 
 
 
530 aa  247  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  29.63 
 
 
1076 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.8 
 
 
529 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.09 
 
 
532 aa  244  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.87 
 
 
487 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.48 
 
 
522 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.79 
 
 
529 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.91 
 
 
545 aa  224  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.61 
 
 
547 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.54 
 
 
532 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.35 
 
 
534 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.31 
 
 
516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.91 
 
 
546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.75 
 
 
534 aa  210  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  29.17 
 
 
558 aa  210  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  28.5 
 
 
557 aa  208  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.76 
 
 
565 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  27.37 
 
 
533 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.13 
 
 
530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.42 
 
 
534 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
539 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.74 
 
 
511 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.42 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.51 
 
 
651 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.59 
 
 
525 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  27.3 
 
 
528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  28.48 
 
 
560 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.93 
 
 
527 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.31 
 
 
531 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.42 
 
 
548 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  25.39 
 
 
523 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.82 
 
 
491 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  38.52 
 
 
485 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.81 
 
 
488 aa  153  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.52 
 
 
484 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.04 
 
 
499 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.73 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  27.08 
 
 
620 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.77 
 
 
486 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.25 
 
 
478 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.25 
 
 
478 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.25 
 
 
478 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  25.37 
 
 
567 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.86 
 
 
478 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.86 
 
 
478 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.99 
 
 
493 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  25.76 
 
 
588 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.39 
 
 
493 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  23.06 
 
 
590 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.99 
 
 
493 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.99 
 
 
493 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.6 
 
 
493 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  31.35 
 
 
493 aa  136  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.6 
 
 
493 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.6 
 
 
493 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  27.65 
 
 
589 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 
493 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  34.39 
 
 
493 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  34.1 
 
 
487 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.96 
 
 
491 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  33.2 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.43 
 
 
499 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.2 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.2 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.52 
 
 
494 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.52 
 
 
494 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  24.96 
 
 
579 aa  128  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  35.53 
 
 
504 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  25.81 
 
 
581 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  31.62 
 
 
486 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  25.32 
 
 
556 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.81 
 
 
495 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  34.36 
 
 
494 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.78 
 
 
493 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.28 
 
 
493 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  23.22 
 
 
575 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.33 
 
 
480 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  25.74 
 
 
587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  25.39 
 
 
580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.81 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.81 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.81 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.81 
 
 
475 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.5 
 
 
490 aa  120  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  24.8 
 
 
579 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  28.91 
 
 
481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  23.86 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  23.33 
 
 
574 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  24.2 
 
 
583 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  30.43 
 
 
490 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  24.78 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  24.25 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.42 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.67 
 
 
477 aa  114  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>