More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3646 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  56.06 
 
 		 574 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  100 
 
 		 589 aa  1185    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  55.5 
 
 		 575 aa  631  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  55.54 
 
 		 573 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  55.54 
 
 		 573 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  55.36 
 
 		 573 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  54.04 
 
 		 580 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  55.09 
 
 		 579 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  52.7 
 
 		 577 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  50.35 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  49.06 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  48.67 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  49.65 
 
 		 570 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  47.91 
 
 		 581 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  50.17 
 
 		 566 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  47.44 
 
 		 572 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  46.49 
 
 		 579 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  46.98 
 
 		 583 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  46.45 
 
 		 581 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  45.28 
 
 		 601 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  45.75 
 
 		 582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  44.52 
 
 		 569 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  44.99 
 
 		 574 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  43.69 
 
 		 587 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  43.35 
 
 		 578 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  43.93 
 
 		 586 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  43.34 
 
 		 587 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  42.03 
 
 		 579 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  41.6 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  41.6 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  41.6 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  40.55 
 
 		 567 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  38.68 
 
 		 560 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  34.36 
 
 		 560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 588 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 577 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.62 
 
 		 582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.04 
 
 		 528 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.98 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.25 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.86 
 
 		 530 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 530 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  37.25 
 
 		 580 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.05 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.65 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.64 
 
 		 532 aa  143  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.21 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.97 
 
 		 565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.32 
 
 		 547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.99 
 
 		 534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.33 
 
 		 534 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  27.65 
 
 		 589 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  28.47 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.54 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.02 
 
 		 484 aa  127  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  28.93 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  29.14 
 
 		 584 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.53 
 
 		 494 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.18 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  31.8 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.22 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.54 
 
 		 486 aa  120  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  34.36 
 
 		 629 aa  120  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  26.43 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  24.87 
 
 		 481 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.72 
 
 		 487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  28.23 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  42.05 
 
 		 490 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  28.03 
 
 		 584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  28 
 
 		 700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  38.42 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  26.83 
 
 		 587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  28.03 
 
 		 584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  25.98 
 
 		 1076 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  28.17 
 
 		 588 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  31 
 
 		 487 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.96 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  38.57 
 
 		 493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  28.17 
 
 		 588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  28.15 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  31.97 
 
 		 493 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  31.97 
 
 		 493 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  31.97 
 
 		 493 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  30.04 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  29.24 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.47 
 
 		 491 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  30.92 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.6 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.61 
 
 		 493 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.85 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.39 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.97 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.39 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.66 
 
 		 651 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.07 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.93 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.61 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.62 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>