More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6046 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  100 
 
 
530 aa  1090    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  43.42 
 
 
534 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.78 
 
 
532 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.21 
 
 
651 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  40.26 
 
 
533 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.56 
 
 
525 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  38.52 
 
 
1076 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.9 
 
 
565 aa  349  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  35.85 
 
 
530 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.77 
 
 
516 aa  343  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  37.04 
 
 
534 aa  336  7.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.94 
 
 
528 aa  320  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  35.26 
 
 
558 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.21 
 
 
533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  36.31 
 
 
493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.86 
 
 
531 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.43 
 
 
494 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.28 
 
 
547 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.31 
 
 
486 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.28 
 
 
545 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  34.02 
 
 
522 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  35.9 
 
 
848 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.24 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.11 
 
 
534 aa  286  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.76 
 
 
477 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.41 
 
 
487 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  34.29 
 
 
481 aa  280  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.9 
 
 
487 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.6 
 
 
527 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.44 
 
 
548 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.59 
 
 
488 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  33.2 
 
 
523 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  35.58 
 
 
486 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.83 
 
 
529 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.16 
 
 
495 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.77 
 
 
493 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 
533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.29 
 
 
478 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.12 
 
 
493 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  33.21 
 
 
534 aa  270  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.59 
 
 
484 aa  270  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  32.95 
 
 
487 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.9 
 
 
478 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.29 
 
 
478 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.1 
 
 
478 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.19 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.19 
 
 
493 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.19 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  35.37 
 
 
493 aa  267  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  35.02 
 
 
490 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.29 
 
 
478 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.23 
 
 
493 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.23 
 
 
493 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.82 
 
 
491 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  35.84 
 
 
475 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  35.84 
 
 
475 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  35.84 
 
 
475 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  35.84 
 
 
475 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  34.99 
 
 
493 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  34.99 
 
 
493 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  34.99 
 
 
493 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.61 
 
 
493 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.67 
 
 
499 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.4 
 
 
480 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.9 
 
 
491 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.96 
 
 
529 aa  261  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  34.54 
 
 
504 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.28 
 
 
511 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  34.56 
 
 
493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.03 
 
 
493 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.83 
 
 
546 aa  259  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.33 
 
 
532 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 
493 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.84 
 
 
479 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  33.21 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.51 
 
 
507 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.5 
 
 
490 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.39 
 
 
494 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.39 
 
 
494 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 
499 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  32.2 
 
 
494 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.57 
 
 
557 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  33.07 
 
 
456 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 
539 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.8 
 
 
620 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  27.13 
 
 
589 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  31.62 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  31.05 
 
 
528 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.68 
 
 
558 aa  173  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  27.55 
 
 
569 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  26.96 
 
 
579 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  29.47 
 
 
587 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  28.12 
 
 
560 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  27.15 
 
 
497 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  27.12 
 
 
580 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  27.86 
 
 
589 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  29.72 
 
 
588 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  26.57 
 
 
582 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  27.62 
 
 
556 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  26.6 
 
 
581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>