More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2980 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  100 
 
 
528 aa  1036    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  49.25 
 
 
620 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  41.46 
 
 
507 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  42.54 
 
 
558 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.87 
 
 
545 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.61 
 
 
532 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.39 
 
 
533 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.52 
 
 
528 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.55 
 
 
522 aa  247  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.61 
 
 
547 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.43 
 
 
529 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  34.33 
 
 
533 aa  236  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.95 
 
 
534 aa  226  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.94 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  32.83 
 
 
533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.79 
 
 
529 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  28.07 
 
 
530 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.12 
 
 
557 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  35.16 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  30.7 
 
 
530 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.17 
 
 
534 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  29.91 
 
 
1076 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.53 
 
 
494 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  31.41 
 
 
493 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  33.09 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.3 
 
 
532 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.96 
 
 
511 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.94 
 
 
651 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.29 
 
 
499 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.48 
 
 
477 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  27.18 
 
 
589 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  29.72 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.76 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.68 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.07 
 
 
527 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.9 
 
 
565 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.32 
 
 
546 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  29.83 
 
 
493 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.78 
 
 
548 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.81 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.27 
 
 
534 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.95 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.51 
 
 
493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.1 
 
 
493 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.76 
 
 
493 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.76 
 
 
493 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.81 
 
 
493 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.18 
 
 
480 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.62 
 
 
495 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.92 
 
 
486 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.83 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.71 
 
 
493 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  29.1 
 
 
485 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.81 
 
 
493 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.81 
 
 
493 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.01 
 
 
491 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.63 
 
 
493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.64 
 
 
531 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.79 
 
 
484 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  28.89 
 
 
486 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.19 
 
 
493 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  29.19 
 
 
493 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  29.19 
 
 
493 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.3 
 
 
491 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.16 
 
 
525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.56 
 
 
499 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.36 
 
 
475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.36 
 
 
475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.36 
 
 
475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.36 
 
 
475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  29.08 
 
 
504 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.96 
 
 
499 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  26.39 
 
 
481 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  23.98 
 
 
523 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  28.22 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.71 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.36 
 
 
478 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.38 
 
 
848 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.17 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.11 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  28.63 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.11 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.92 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.33 
 
 
487 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  29.92 
 
 
494 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.93 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.93 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  28.08 
 
 
580 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  29.05 
 
 
560 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  26.83 
 
 
582 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  26.06 
 
 
579 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  24.64 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  25.69 
 
 
574 aa  97.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  23.03 
 
 
456 aa  95.9  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  26.37 
 
 
581 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  26.11 
 
 
577 aa  93.6  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  26.43 
 
 
556 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  26.43 
 
 
589 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  25.69 
 
 
578 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  28.22 
 
 
567 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>