196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0551 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
479 aa  998    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  64.02 
 
 
485 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  72.8 
 
 
480 aa  745    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.15 
 
 
487 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.33 
 
 
493 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  63.05 
 
 
504 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  63.48 
 
 
493 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  63.48 
 
 
493 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  63.48 
 
 
493 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.63 
 
 
491 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  63.69 
 
 
493 aa  621  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  63.31 
 
 
487 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.48 
 
 
493 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.48 
 
 
493 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.91 
 
 
493 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.06 
 
 
493 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.63 
 
 
493 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.06 
 
 
493 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.63 
 
 
493 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  62.47 
 
 
481 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.21 
 
 
493 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.85 
 
 
495 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  61.75 
 
 
494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  61.75 
 
 
494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  62.16 
 
 
494 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62 
 
 
475 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62 
 
 
475 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62 
 
 
475 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62 
 
 
475 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  58.04 
 
 
499 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.71 
 
 
488 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.64 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  47.88 
 
 
493 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.08 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.89 
 
 
486 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.33 
 
 
499 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.53 
 
 
493 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.75 
 
 
491 aa  435  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.35 
 
 
490 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  44.6 
 
 
493 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.05 
 
 
494 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  46.04 
 
 
486 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.17 
 
 
478 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.91 
 
 
478 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.7 
 
 
478 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.38 
 
 
478 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.7 
 
 
478 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  44.75 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  35.04 
 
 
533 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 
530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  35.1 
 
 
848 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.42 
 
 
532 aa  269  8.999999999999999e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.01 
 
 
533 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  33.84 
 
 
530 aa  266  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.83 
 
 
516 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.72 
 
 
528 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 
534 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.93 
 
 
499 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.33 
 
 
525 aa  247  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.34 
 
 
651 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.27 
 
 
1076 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.88 
 
 
522 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.33 
 
 
534 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.46 
 
 
534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.28 
 
 
547 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  32.39 
 
 
533 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.64 
 
 
529 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.63 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.23 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.33 
 
 
557 aa  219  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  31.68 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.06 
 
 
546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.25 
 
 
565 aa  210  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.25 
 
 
511 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.57 
 
 
507 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.86 
 
 
532 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.37 
 
 
531 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.89 
 
 
548 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  38.38 
 
 
558 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  28.02 
 
 
523 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  28.39 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.48 
 
 
545 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.5 
 
 
527 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  25.86 
 
 
534 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  26.91 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  28.69 
 
 
558 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  25.77 
 
 
481 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  32.42 
 
 
589 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  26.25 
 
 
493 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  34.36 
 
 
582 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  30.29 
 
 
589 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  32.75 
 
 
560 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  32.03 
 
 
620 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  35.26 
 
 
588 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  34.55 
 
 
556 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  30.34 
 
 
577 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  29.39 
 
 
581 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  31.34 
 
 
586 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  31.34 
 
 
586 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  31.34 
 
 
586 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>