173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1467 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
565 aa  1149    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  43.68 
 
 
1076 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.15 
 
 
651 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.34 
 
 
548 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.78 
 
 
532 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  35.38 
 
 
530 aa  365  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  37.05 
 
 
533 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.53 
 
 
534 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.77 
 
 
533 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  36.9 
 
 
530 aa  349  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.44 
 
 
545 aa  339  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.76 
 
 
487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.65 
 
 
528 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  36.13 
 
 
534 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.21 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.96 
 
 
525 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  35.99 
 
 
558 aa  316  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.96 
 
 
522 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.7 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.45 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.07 
 
 
516 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.02 
 
 
529 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.77 
 
 
531 aa  286  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  33.33 
 
 
534 aa  283  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.46 
 
 
533 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.26 
 
 
546 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.89 
 
 
557 aa  256  7e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  33.39 
 
 
539 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.15 
 
 
511 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.22 
 
 
493 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.01 
 
 
534 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.52 
 
 
507 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.02 
 
 
488 aa  246  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.75 
 
 
493 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  33.08 
 
 
493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.08 
 
 
493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.08 
 
 
493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.15 
 
 
493 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.56 
 
 
493 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.95 
 
 
495 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.56 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.56 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.46 
 
 
475 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.46 
 
 
475 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.46 
 
 
475 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  33.46 
 
 
475 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  31.98 
 
 
523 aa  240  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.18 
 
 
493 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.14 
 
 
484 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.21 
 
 
499 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.91 
 
 
491 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  31.19 
 
 
481 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.83 
 
 
486 aa  237  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.09 
 
 
478 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.9 
 
 
478 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.76 
 
 
493 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.09 
 
 
478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.07 
 
 
848 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.99 
 
 
493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.99 
 
 
493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.44 
 
 
527 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  30.45 
 
 
485 aa  233  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.34 
 
 
494 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.19 
 
 
478 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  30.58 
 
 
493 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.19 
 
 
478 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.71 
 
 
477 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.96 
 
 
499 aa  223  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.21 
 
 
490 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.04 
 
 
491 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.4 
 
 
493 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  30.94 
 
 
480 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  29.85 
 
 
504 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.62 
 
 
487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  30.45 
 
 
487 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.91 
 
 
494 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.91 
 
 
494 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.95 
 
 
499 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  31.01 
 
 
493 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  26.76 
 
 
589 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  29.46 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.57 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  29.66 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.52 
 
 
620 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  28.57 
 
 
490 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  31.26 
 
 
560 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.3 
 
 
558 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  26.5 
 
 
456 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  27.65 
 
 
528 aa  166  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  27.65 
 
 
577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  26.25 
 
 
481 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  27.75 
 
 
582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  29.7 
 
 
567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  26.93 
 
 
579 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  25.98 
 
 
587 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  26.57 
 
 
581 aa  143  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  27.26 
 
 
580 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  28.07 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  27.52 
 
 
578 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  27.97 
 
 
589 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>