271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4020 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  69.39 
 
 
494 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  67.98 
 
 
475 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 
487 aa  989    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.4 
 
 
493 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  69.85 
 
 
493 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.31 
 
 
493 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.19 
 
 
493 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.57 
 
 
493 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  69.34 
 
 
493 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.67 
 
 
493 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  69.85 
 
 
493 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.46 
 
 
493 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  88.22 
 
 
487 aa  874    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.9 
 
 
495 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.19 
 
 
493 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  69.92 
 
 
494 aa  686    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  69.92 
 
 
494 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.19 
 
 
493 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.19 
 
 
493 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  67.98 
 
 
475 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  67.98 
 
 
475 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  69.85 
 
 
493 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  67.98 
 
 
475 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  64.85 
 
 
504 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  65.9 
 
 
485 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.44 
 
 
491 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.73 
 
 
479 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  60.13 
 
 
481 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62.18 
 
 
480 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  59.92 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.17 
 
 
484 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.07 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  47.02 
 
 
493 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.89 
 
 
477 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.74 
 
 
494 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.22 
 
 
486 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  48.84 
 
 
493 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.74 
 
 
499 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.6 
 
 
491 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 
478 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.06 
 
 
478 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 
478 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.6 
 
 
478 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.6 
 
 
478 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  47.3 
 
 
490 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  47.29 
 
 
486 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.2 
 
 
493 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.69 
 
 
490 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.3 
 
 
533 aa  290  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.89 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  33.9 
 
 
530 aa  279  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.94 
 
 
499 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  36.01 
 
 
848 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.01 
 
 
525 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.76 
 
 
534 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.26 
 
 
528 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  32.14 
 
 
530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  34.64 
 
 
558 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.52 
 
 
1076 aa  249  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  34.45 
 
 
522 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.97 
 
 
547 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.43 
 
 
534 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.9 
 
 
534 aa  236  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  32.39 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.35 
 
 
529 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.58 
 
 
487 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35 
 
 
516 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.33 
 
 
651 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.27 
 
 
545 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.11 
 
 
557 aa  217  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.51 
 
 
546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.62 
 
 
565 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  34.15 
 
 
539 aa  213  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.46 
 
 
511 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.46 
 
 
532 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.57 
 
 
529 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.63 
 
 
531 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  29.09 
 
 
523 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  29.24 
 
 
534 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.89 
 
 
507 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.71 
 
 
527 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  33.15 
 
 
620 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.84 
 
 
533 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  27.48 
 
 
456 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.46 
 
 
558 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.99 
 
 
548 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  27.24 
 
 
528 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  33.33 
 
 
589 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  35.22 
 
 
556 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  25.41 
 
 
493 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  27.51 
 
 
579 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  26.56 
 
 
481 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  24.78 
 
 
569 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  31.91 
 
 
577 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  27.09 
 
 
560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  41.58 
 
 
588 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  31.03 
 
 
587 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  31.72 
 
 
589 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  33.22 
 
 
578 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  35.18 
 
 
601 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>