237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5117 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  100 
 
 		 504 aa  1029    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  92.26 
 
 		 491 aa  937    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  79.75 
 
 		 485 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  65.69 
 
 		 487 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.85 
 
 		 487 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.39 
 
 		 494 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.39 
 
 		 494 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.64 
 
 		 493 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  65.13 
 
 		 495 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  64.44 
 
 		 494 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.48 
 
 		 493 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.05 
 
 		 479 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  61.38 
 
 		 493 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  64.69 
 
 		 493 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.79 
 
 		 493 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  64.06 
 
 		 493 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  64.69 
 
 		 493 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  64.69 
 
 		 493 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  61.38 
 
 		 480 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63 
 
 		 493 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63 
 
 		 493 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.06 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.58 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  62.58 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62.79 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  58.04 
 
 		 481 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62.79 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62.79 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62.79 
 
 		 475 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  58.96 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  48.87 
 
 		 493 aa  458  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.27 
 
 		 484 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.59 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.87 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  50 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.68 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.05 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.54 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.15 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.39 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  46.46 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.06 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.85 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  45.7 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.85 
 
 		 478 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.96 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.49 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.91 
 
 		 478 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.29 
 
 		 533 aa  280  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.15 
 
 		 528 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.53 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 530 aa  263  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.54 
 
 		 530 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  35.18 
 
 		 848 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.65 
 
 		 534 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.05 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.46 
 
 		 1076 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  34.56 
 
 		 558 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.72 
 
 		 534 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.51 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.96 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.77 
 
 		 522 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.16 
 
 		 547 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.51 
 
 		 529 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.5 
 
 		 487 aa  236  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 		 533 aa  232  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.41 
 
 		 651 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.85 
 
 		 565 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.1 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.45 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.09 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.82 
 
 		 511 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.71 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.14 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  32.58 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.34 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.35 
 
 		 532 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.76 
 
 		 531 aa  180  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  28.82 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  28.14 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.02 
 
 		 534 aa  160  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.69 
 
 		 527 aa  160  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.97 
 
 		 620 aa  156  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.01 
 
 		 528 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.38 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  28.12 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  34.63 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  35.53 
 
 		 589 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  30.68 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  41.84 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  25.52 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  34.93 
 
 		 556 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  36.92 
 
 		 583 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  30.13 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  34.87 
 
 		 574 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  28.96 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  34.36 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  33 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>