299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0641 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  67.36 
 
 		 494 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 493 aa  1008    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.1 
 
 		 475 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.67 
 
 		 487 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.1 
 
 		 475 aa  808    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  83.54 
 
 		 493 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.1 
 
 		 475 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  65.15 
 
 		 485 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.18 
 
 		 493 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.38 
 
 		 493 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  83.98 
 
 		 493 aa  854    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  83.54 
 
 		 493 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.79 
 
 		 493 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  95.33 
 
 		 493 aa  950    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  83.54 
 
 		 493 aa  846    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  68.87 
 
 		 487 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  88.34 
 
 		 495 aa  880    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.58 
 
 		 493 aa  865    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.58 
 
 		 493 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.38 
 
 		 493 aa  864    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.62 
 
 		 494 aa  670    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  81.1 
 
 		 475 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  84.58 
 
 		 493 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.62 
 
 		 494 aa  670    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.45 
 
 		 491 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  63.64 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  64.33 
 
 		 479 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62.66 
 
 		 480 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  61.39 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  60 
 
 		 499 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  50.21 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.2 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  50.96 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.11 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.9 
 
 		 488 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.68 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.2 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  49.06 
 
 		 486 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.76 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.22 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.96 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  47.17 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.73 
 
 		 490 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.57 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.57 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.36 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.74 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.11 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.4 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.99 
 
 		 533 aa  286  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 		 530 aa  276  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.22 
 
 		 525 aa  267  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35 
 
 		 534 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.67 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  35.38 
 
 		 848 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.39 
 
 		 522 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.03 
 
 		 530 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.21 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.9 
 
 		 534 aa  257  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.95 
 
 		 547 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.12 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.22 
 
 		 565 aa  249  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.61 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  30.89 
 
 		 1076 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.3 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.73 
 
 		 545 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.77 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.85 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  34.35 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.84 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.71 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.37 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.78 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.78 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.72 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.05 
 
 		 531 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  33.08 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.35 
 
 		 546 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  29.36 
 
 		 534 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.52 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  31.19 
 
 		 620 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  27.66 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  37.54 
 
 		 558 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  28.54 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  28.19 
 
 		 456 aa  156  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 577 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.21 
 
 		 558 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  27.84 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.99 
 
 		 548 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  25.87 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  33.46 
 
 		 589 aa  134  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  41.24 
 
 		 583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  38.14 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  34.78 
 
 		 579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  38.66 
 
 		 588 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  37.24 
 
 		 582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  34.85 
 
 		 567 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  37.44 
 
 		 578 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  31.76 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  25.71 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>